238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0151 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0151  Uracil-DNA glycosylase superfamily  100 
 
 		 257 aa  520  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818415 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0138  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  72.87 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0590292  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3028  uracil-DNA glycosylase  40.55 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0789088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  41.2 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2764  uracil-DNA glycosylase  39.2 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3129  uracil-DNA glycosylase  39.2 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.532075 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  37.9 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2887  uracil-DNA glycosylase  39.84 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  40 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  36.71 
 
 		 222 aa  148  8e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  38.49 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  39.15 
 
 		 231 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  38.24 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3648  uracil-DNA glycosylase  39.15 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  35.48 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  37.5 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  41.31 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  40.38 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  40.85 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3600  uracil-DNA glycosylase  37.75 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0245858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  40.85 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  40.85 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  40.38 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  40.85 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  38.21 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  40.38 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  36.02 
 
 		 216 aa  143  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  38.33 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  38.71 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  37.5 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  39.82 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0224  uracil-DNA glycosylase  41.26 
 
 		 211 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0456  uracil-DNA glycosylase  39.51 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  36.63 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  36.63 
 
 		 262 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  36.63 
 
 		 262 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  39.91 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  37.04 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  39.91 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  36.18 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  39.91 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  39.91 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  37.04 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  36.36 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  37.04 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1915  uracil-DNA glycosylase  37.04 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  36.36 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  39.51 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  36.4 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  37.55 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2914  uracil-DNA glycosylase  36.63 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  39.91 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2583  uracil-DNA glycosylase  40.19 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  39.57 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  39.91 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  40 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  38.72 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  36.61 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0514  uracil-DNA glycosylase  40.62 
 
 		 233 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  40.48 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  40 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  36.29 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  36.44 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0580  uracil-DNA glycosylase  39.74 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  42.51 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  38.3 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  40 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  38.3 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  38.3 
 
 		 230 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  36.55 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  37.24 
 
 		 223 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  33.89 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  33.05 
 
 		 216 aa  138  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  36.29 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  33.89 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  38.3 
 
 		 230 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  37.04 
 
 		 253 aa  138  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  37.04 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  39 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  39.61 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  37.34 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0587  uracil-DNA glycosylase  39.04 
 
 		 241 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  36.36 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  39.52 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4644  uracil-DNA glycosylase  39.42 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1846  uracil-DNA glycosylase  38.72 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963093  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  38.24 
 
 		 225 aa  136  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  37.87 
 
 		 230 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3616  uracil-DNA glycosylase  37.04 
 
 		 301 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  39.51 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  37.5 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  35.59 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  36.63 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  39.51 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  38.24 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1473  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.78 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113143 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  36.71 
 
 		 222 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0054  uracil-DNA glycosylase  33.88 
 
 		 223 aa  135  9e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  38.57 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3875  uracil-DNA glycosylase  40.08 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>