63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4124 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4124  transposase Tn3  100 
 
 		 102 aa  209  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632177 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  66.29 
 
 		 988 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  59.41 
 
 		 988 aa  110  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  59.41 
 
 		 988 aa  110  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  59.41 
 
 		 988 aa  110  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  59.41 
 
 		 988 aa  110  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  57.28 
 
 		 989 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  62.5 
 
 		 985 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  55.45 
 
 		 988 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  60.67 
 
 		 988 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  59.55 
 
 		 964 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  60.23 
 
 		 989 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  61.36 
 
 		 988 aa  103  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  60.67 
 
 		 990 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  60.67 
 
 		 990 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  60.67 
 
 		 990 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  60.67 
 
 		 526 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  59.09 
 
 		 990 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  59.09 
 
 		 990 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  59.09 
 
 		 990 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  74.6 
 
 		 990 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  79.03 
 
 		 988 aa  98.2  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  79.03 
 
 		 988 aa  98.2  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  75.81 
 
 		 988 aa  94.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  68.75 
 
 		 988 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  72.58 
 
 		 1015 aa  93.6  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  60.87 
 
 		 731 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  67.19 
 
 		 988 aa  90.5  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  67.19 
 
 		 988 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  67.19 
 
 		 988 aa  90.5  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1051  transposase Tn3  47.92 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  57.35 
 
 		 988 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  57.35 
 
 		 988 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  57.35 
 
 		 988 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  54.84 
 
 		 961 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  53.23 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  56.45 
 
 		 992 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  56.45 
 
 		 992 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  49.38 
 
 		 994 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  51.61 
 
 		 400 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3677  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.472291 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  50 
 
 		 991 aa  67.8  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  50 
 
 		 991 aa  67.8  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  52.38 
 
 		 994 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  52.38 
 
 		 994 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  52.38 
 
 		 440 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  47.83 
 
 		 991 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  47.06 
 
 		 983 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  51.61 
 
 		 999 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  46.77 
 
 		 877 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  43.75 
 
 		 992 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  46.77 
 
 		 996 aa  57  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  46.77 
 
 		 996 aa  57  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  46.77 
 
 		 996 aa  57  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  43.55 
 
 		 983 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  42.37 
 
 		 738 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  43.08 
 
 		 987 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  50 
 
 		 612 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  47.76 
 
 		 988 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  47.76 
 
 		 988 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  43.55 
 
 		 996 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  37.1 
 
 		 988 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  37.29 
 
 		 968 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>