35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2899 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  100 
 
 		 333 aa  676    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  43.29 
 
 		 973 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  39.82 
 
 		 918 aa  215  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  36.09 
 
 		 925 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  32.53 
 
 		 1184 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  45.81 
 
 		 1173 aa  132  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1170 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  33.13 
 
 		 1154 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  30.3 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1151 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  35.22 
 
 		 1186 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 869 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  29 
 
 		 1018 aa  92.4  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  32.7 
 
 		 1188 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  29.57 
 
 		 978 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1346 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  33.13 
 
 		 1363 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1347 aa  72.8  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1353 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1282 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1365 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1243 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  30 
 
 		 536 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1321 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1347 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1342 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1339 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1339 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1409 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1440 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1366 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1290 aa  49.7  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1441 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  30.28 
 
 		 916 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  43.59 
 
 		 912 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>