More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2348 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2348  ankyrin  100 
 
 
149 aa  303  8.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.614743  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1462  ankyrin repeat-containing protein  61.15 
 
 
196 aa  163  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  52 
 
 
258 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7751  ankyrin  50.36 
 
 
196 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.493999  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2350  ankyrin  51.2 
 
 
255 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  45.74 
 
 
260 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  45.74 
 
 
260 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  41.09 
 
 
263 aa  90.1  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  40.43 
 
 
261 aa  90.1  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1423  ankyrin  40.85 
 
 
152 aa  87.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.853849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2101  Ankyrin  38.58 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  41.84 
 
 
245 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  38.1 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2061  hypothetical protein  35.4 
 
 
584 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  36.44 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  44.21 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  42.45 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  42.45 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  36.63 
 
 
404 aa  65.1  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  36.04 
 
 
490 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  37.68 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  33.61 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  32.58 
 
 
1030 aa  63.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  32.79 
 
 
1585 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3277  ankyrin  33.93 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  41.51 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3944  ankyrin  37.5 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0207728 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2051  hypothetical protein  35.58 
 
 
583 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  33.05 
 
 
178 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  37.07 
 
 
220 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  34.58 
 
 
1156 aa  61.6  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  29.36 
 
 
382 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  38.68 
 
 
200 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  38.79 
 
 
181 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  38.05 
 
 
337 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  40.19 
 
 
870 aa  60.8  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  36.45 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  40.4 
 
 
176 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  36.36 
 
 
194 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  34.62 
 
 
174 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  33.64 
 
 
1061 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.61 
 
 
1402 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0645  Ankyrin  29.91 
 
 
240 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  35.54 
 
 
192 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  37.74 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.89 
 
 
2413 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  36.79 
 
 
181 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  35.45 
 
 
2171 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  36.36 
 
 
195 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3255  ankyrin  33.65 
 
 
395 aa  58.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  33.98 
 
 
891 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  34.91 
 
 
347 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  34.74 
 
 
178 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1438  ankyrin  41.76 
 
 
248 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0488  ankyrin  33.91 
 
 
176 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02195  conserved hypothetical protein  37.25 
 
 
1800 aa  57  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222907  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3533  Ankyrin  36.13 
 
 
173 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.254367  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  34.74 
 
 
170 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  33.98 
 
 
483 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  37.62 
 
 
184 aa  57  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  34.19 
 
 
155 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  39.81 
 
 
201 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  33.04 
 
 
305 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  35.82 
 
 
208 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  33.61 
 
 
346 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  34.13 
 
 
442 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  34.04 
 
 
483 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  32.03 
 
 
646 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  33.02 
 
 
715 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  36.13 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  38.53 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3561  Ankyrin  34.21 
 
 
331 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  38.83 
 
 
227 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1071  ankyrin  36 
 
 
342 aa  55.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1663  FOG: Ankyrin repeat protein  37.84 
 
 
285 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.10004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  34.29 
 
 
321 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  37.04 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  33.06 
 
 
214 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  41.41 
 
 
190 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  35.71 
 
 
189 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  31.09 
 
 
1249 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  32.67 
 
 
173 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  30.7 
 
 
790 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_9194  predicted protein  35.23 
 
 
98 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  36.45 
 
 
274 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  37.61 
 
 
171 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  36.59 
 
 
203 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35.85 
 
 
731 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  29.79 
 
 
450 aa  54.7  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  33.91 
 
 
494 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2666  ankyrin  40.4 
 
 
237 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.931958  hitchhiker  0.000000569803 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  33.02 
 
 
762 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  32.61 
 
 
544 aa  53.9  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  37.5 
 
 
149 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1999  ankyrin repeat-containing protein  31.82 
 
 
512 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.224221 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03775  conserved hypothetical protein  35.05 
 
 
307 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  36.54 
 
 
210 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  31.2 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0781  aankyrin repeat-containing protein  34.51 
 
 
261 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150495  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  29.6 
 
 
426 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>