More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2350 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2350  ankyrin  100 
 
 
255 aa  518  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  70.47 
 
 
258 aa  363  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  45.88 
 
 
263 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  49.58 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  49.58 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 
245 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  40.56 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  42.86 
 
 
254 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1462  ankyrin repeat-containing protein  54.41 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1423  ankyrin  51.41 
 
 
152 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.853849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2348  ankyrin  51.2 
 
 
149 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.614743  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2101  Ankyrin  41.26 
 
 
153 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7751  ankyrin  44.44 
 
 
196 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.493999  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3944  ankyrin  42.22 
 
 
174 aa  92.4  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0207728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  37.04 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  37.5 
 
 
347 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  34.19 
 
 
1585 aa  72  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  35.48 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  35.64 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  33.83 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  30.67 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  34.95 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2051  hypothetical protein  39.81 
 
 
583 aa  68.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0662  ankyrin  32.82 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00179604  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2061  hypothetical protein  38.18 
 
 
584 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  35 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  44 
 
 
656 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  33.94 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  41.24 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1395  Ankyrin  29.95 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3653  ankyrin repeat-containing protein  39.66 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  28.85 
 
 
107 aa  65.1  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  35.04 
 
 
490 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  30.77 
 
 
427 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  35.51 
 
 
762 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  30.95 
 
 
163 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0963  ankyrin  30.14 
 
 
236 aa  63.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  40 
 
 
187 aa  62.8  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  33.9 
 
 
931 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  34.4 
 
 
138 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0582  ankyrin  35.4 
 
 
344 aa  62  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  43.42 
 
 
108 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  36.04 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.97 
 
 
2413 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  33.01 
 
 
790 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 
106 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  34.43 
 
 
711 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  33.9 
 
 
544 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.48 
 
 
1402 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  38.26 
 
 
870 aa  60.1  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  32.9 
 
 
287 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3561  Ankyrin  37.27 
 
 
331 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  34.62 
 
 
1198 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  38.89 
 
 
274 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  37.29 
 
 
756 aa  59.7  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  34.71 
 
 
1061 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  29.92 
 
 
715 aa  59.3  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  32.98 
 
 
106 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 
101 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 
101 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 
101 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 
101 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  36 
 
 
110 aa  58.9  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
102 aa  58.9  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 
123 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2481  Ankyrin  34.07 
 
 
391 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000229526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3296  ankyrin  35.19 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  36.72 
 
 
337 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6564  Ankyrin  37.27 
 
 
166 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  32.56 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
102 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  33.64 
 
 
1030 aa  57.4  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  34.45 
 
 
474 aa  57.4  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1438  ankyrin  33.63 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  33.64 
 
 
891 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  33.9 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  33.33 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  31.82 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  31.25 
 
 
162 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  31.09 
 
 
640 aa  57  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  30.56 
 
 
483 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1824  ankyrin  31.82 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109877  hitchhiker  0.0044061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 
102 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2499  Ankyrin  33.6 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0280385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  33.06 
 
 
208 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  34.58 
 
 
811 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  30.41 
 
 
494 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  32.98 
 
 
112 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  33.05 
 
 
155 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1144  hypothetical protein  32.29 
 
 
2122 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  30.3 
 
 
185 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  30.3 
 
 
185 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 
158 aa  55.8  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0285  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  31.09 
 
 
200 aa  55.8  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  29.91 
 
 
109 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02010  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  33.61 
 
 
236 aa  55.5  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  35.11 
 
 
110 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  34.45 
 
 
220 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  29.77 
 
 
865 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>