More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1627 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1627  response regulator receiver protein  100 
 
 		 119 aa  237  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  59.48 
 
 		 119 aa  141  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1426  response regulator receiver protein  53.45 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1469  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1423  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0187  response regulator receiver protein  50.89 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.283319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0458  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0029  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3403  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.809384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2959  two component signal transduction response regulator  43.1 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.888929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3466  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0854  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0406  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2332  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3609  response regulator receiver domain-containing protein  40.35 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1117  response regulator  36.75 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2017  response regulator CheY  35.34 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2679  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.380915  normal  0.27601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1110  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2829  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3253  response regulator  37.93 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3179  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.164981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0435  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00876892  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  37.29 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  40.74 
 
 		 573 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1981  two-component response regulator, sigma-54 related  37.76 
 
 		 448 aa  77  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472322  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2934  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000852899  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3227  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.696337 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2553  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1194499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0016  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  36.11 
 
 		 468 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0855054  normal  0.786337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2092  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 462 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1660  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 575 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1174  putative two-component response regulator  31.09 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2370  two component transcriptional regulator  31.09 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.223285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2641  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 239 aa  74.7  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  34.45 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 		 548 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1554  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.75 
 
 		 419 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 		 487 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 831 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  33.04 
 
 		 575 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 		 812 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 473 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2077  vncR, response regulator  40.17 
 
 		 217 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00119329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0970  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.59 
 
 		 459 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000694494  normal  0.524712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1381 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4752  response regulator  37.5 
 
 		 229 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.84 
 
 		 473 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 		 822 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.84 
 
 		 473 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 457 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  35.29 
 
 		 227 aa  73.6  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 810 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0616  DNA-binding response regulator VncR  39.32 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4970  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.93 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  46.34 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02147  fused response regulator of ato operon, in two-component system with AtoS: response regulator/sigma54 interaction protein  30.58 
 
 		 461 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1438  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.58 
 
 		 461 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445705  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 857 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  36.97 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  30.58 
 
 		 461 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.05 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 		 496 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  30.58 
 
 		 461 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 845 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02106  hypothetical protein  30.58 
 
 		 461 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2361  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  30.58 
 
 		 461 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.18992  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0766  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.528482  normal  0.302775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3997  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0883649 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 		 539 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5422  histidine kinase  41.46 
 
 		 685 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0504919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1088  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 264 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.04 
 
 		 229 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1361  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1028  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  34.91 
 
 		 468 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.070914  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3323  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.61 
 
 		 458 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>