More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1330 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
349 aa  703    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.22 
 
 
311 aa  442  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.63 
 
 
349 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1073  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  56.32 
 
 
346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.87 
 
 
346 aa  376  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.618747  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0719  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  37.64 
 
 
349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
356 aa  216  5e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.881035  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
356 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
358 aa  202  6e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.606481  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
356 aa  200  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.125633 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
354 aa  188  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0953603  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
370 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0478447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
372 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.433109 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
354 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.798458  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
372 aa  162  6e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.231661  normal  0.721706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
326 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.56 
 
 
326 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
338 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
340 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  32.65 
 
 
324 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
321 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
321 aa  155  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
321 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 
321 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
340 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
344 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7447  ABC transporter, permease  29.68 
 
 
346 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  32.88 
 
 
321 aa  152  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
326 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2322  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  33.92 
 
 
348 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.85 
 
 
340 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  32.88 
 
 
321 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
344 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00114687  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
342 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552398  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3654  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
304 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.46 
 
 
327 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
318 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.46 
 
 
326 aa  149  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00450006  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.77 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.887108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0525112  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 
307 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  30.82 
 
 
307 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  30.82 
 
 
318 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  30.82 
 
 
318 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
325 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0648374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 
318 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2469  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.97 
 
 
345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0777268  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
324 aa  146  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.15877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
322 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.45 
 
 
325 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314534  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.77 
 
 
333 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
322 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618484  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
321 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
325 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5300  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  33.2 
 
 
316 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
347 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2742  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
344 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.564581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  30.82 
 
 
318 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
321 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
313 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.91 
 
 
318 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.91 
 
 
307 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.43 
 
 
326 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
327 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 
332 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
327 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
307 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30112  hitchhiker  0.0000547502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
320 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.75 
 
 
328 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000643204  unclonable  0.00000000002362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
339 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.186938  normal  0.127201 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00639  ABC transporter permease component  31.09 
 
 
341 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
318 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
305 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
323 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
328 aa  142  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.892452  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
350 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.106153  normal  0.226487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.47 
 
 
318 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
350 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.673623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
350 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.77 
 
 
323 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
349 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  hitchhiker  0.0000268959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
349 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 
363 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2992  ABC transporter, inner membrane subunit  31.91 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712485  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001854  putative transmembrane ABC transporter protein  30.77 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
344 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291354  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5000  ABC transporter, inner membrane subunit  31.91 
 
 
350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47497  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.46 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>