More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4422 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4422  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.633986 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  60.27 
 
 		 250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  59.82 
 
 		 250 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0706  flagellar biosynthesis protein FliP  62.2 
 
 		 256 aa  278  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0239  flagellar biosynthesis protein FliP  62.2 
 
 		 256 aa  278  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.197588  normal  0.0281676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0626  flagellar biosynthesis protein FliP  62.2 
 
 		 256 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  59.38 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  59.82 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3593  flagellar biosynthesis protein FliP  59.29 
 
 		 245 aa  251  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  53.44 
 
 		 255 aa  248  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0089  flagellar biosynthesis protein FliP  58.74 
 
 		 242 aa  246  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3664  flagellar biosynthesis protein FliP  60.18 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  53.44 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  53.44 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  58.57 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  53.44 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  53.44 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3984  flagellar biosynthesis protein FliP  56.85 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0083  flagellar biosynthesis protein FliP  60.09 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3481  flagellar biosynthesis protein FliP  58.93 
 
 		 244 aa  242  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  55.07 
 
 		 289 aa  241  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  55.56 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  52.86 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  55.14 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  52.86 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  52.12 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  52.12 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  52.89 
 
 		 248 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  52.89 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  52.89 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  56.48 
 
 		 252 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  52.4 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  57.14 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  54.46 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  50.61 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  51.23 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  53.25 
 
 		 251 aa  232  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  54.93 
 
 		 261 aa  230  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  57.01 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  56.56 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  51.98 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  49.39 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  51.64 
 
 		 252 aa  228  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  51.5 
 
 		 278 aa  228  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  54.34 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  50.6 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  49.2 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  49.8 
 
 		 279 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  54.21 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  54.34 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  54.34 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  54.67 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  54.34 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  54.93 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  47.67 
 
 		 281 aa  225  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  54.93 
 
 		 255 aa  224  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  53.64 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  50.67 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  53.45 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  48.19 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  48.19 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  51.29 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  48.19 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  53.64 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  46.3 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  53.18 
 
 		 276 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  53.18 
 
 		 276 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  48.19 
 
 		 253 aa  221  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  52.19 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  48.5 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  49.19 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  50.63 
 
 		 274 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  50.63 
 
 		 274 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  49.19 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1331  flagellar biosynthetic protein FliP  52.5 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.7654  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0978  flagellar biosynthesis protein FliP  52.03 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  0.0315075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  48.48 
 
 		 261 aa  218  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  52.58 
 
 		 249 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  52.73 
 
 		 253 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  52.27 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  54.98 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  52.27 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  53.27 
 
 		 274 aa  217  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  52.09 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  52.61 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  52.09 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  50.71 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  52.42 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  47.93 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  49.19 
 
 		 245 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  48.37 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  52.88 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  52.11 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  52.11 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  48.37 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  48.37 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  48.37 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  48.37 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  48.37 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  48.37 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>