More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3994 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 533 aa  1094    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  61.76 
 
 		 528 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  59.31 
 
 		 530 aa  625  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  59.69 
 
 		 530 aa  622  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  61.61 
 
 		 528 aa  621  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  60.85 
 
 		 525 aa  620  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  56.65 
 
 		 529 aa  620  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  59.88 
 
 		 530 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  58.65 
 
 		 529 aa  615  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  58.54 
 
 		 528 aa  609  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  60.95 
 
 		 528 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  60.24 
 
 		 526 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  60.24 
 
 		 526 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  59.31 
 
 		 529 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  58.07 
 
 		 526 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1311  glucose-6-phosphate isomerase  57.85 
 
 		 529 aa  585  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  57.63 
 
 		 505 aa  586  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  53.46 
 
 		 533 aa  568  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  58.72 
 
 		 515 aa  551  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  54.81 
 
 		 532 aa  544  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  55.56 
 
 		 552 aa  537  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0320  glucose-6-phosphate isomerase  53.2 
 
 		 532 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181153  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  52.69 
 
 		 536 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09931  glucose-6-phosphate isomerase  52.2 
 
 		 532 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87905  normal  0.412023 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08741  glucose-6-phosphate isomerase  52.8 
 
 		 532 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326776 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09691  glucose-6-phosphate isomerase  47.76 
 
 		 527 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  46.65 
 
 		 527 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09711  glucose-6-phosphate isomerase  47.56 
 
 		 527 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0910  glucose-6-phosphate isomerase  47.17 
 
 		 527 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347929  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  30.89 
 
 		 539 aa  185  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  31.44 
 
 		 547 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  36.27 
 
 		 479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  34.16 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2573  glucose-6-phosphate isomerase  31.95 
 
 		 525 aa  177  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00324462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1849  glucose-6-phosphate isomerase  33.18 
 
 		 546 aa  178  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  33.49 
 
 		 477 aa  177  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  31.22 
 
 		 545 aa  169  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  32.1 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  32.58 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  32.1 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  31.65 
 
 		 548 aa  168  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  33.16 
 
 		 457 aa  167  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.23 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  31.43 
 
 		 559 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  31.08 
 
 		 549 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  29.98 
 
 		 562 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  32.59 
 
 		 438 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  32.59 
 
 		 439 aa  163  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  31.24 
 
 		 545 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  32.38 
 
 		 550 aa  163  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  31.79 
 
 		 550 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  33.06 
 
 		 453 aa  162  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  31.07 
 
 		 549 aa  161  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  31.07 
 
 		 549 aa  161  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  30.2 
 
 		 549 aa  161  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1971  glucose-6-phosphate isomerase  29.92 
 
 		 537 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.799071  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  30.86 
 
 		 549 aa  160  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0307  glucose-6-phosphate isomerase  30.96 
 
 		 549 aa  160  7e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  32.98 
 
 		 548 aa  159  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1008  Glucose-6-phosphate isomerase  34.63 
 
 		 553 aa  159  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.6147  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  31.21 
 
 		 547 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  33.69 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  32.13 
 
 		 541 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  31.51 
 
 		 549 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  31.51 
 
 		 549 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  31.51 
 
 		 549 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  31.51 
 
 		 549 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  30.39 
 
 		 549 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  31.51 
 
 		 549 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  30.67 
 
 		 545 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  31.51 
 
 		 549 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  31.51 
 
 		 549 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  31.63 
 
 		 547 aa  157  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  31.21 
 
 		 545 aa  157  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0581  glucose-6-phosphate isomerase  32.49 
 
 		 526 aa  156  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.23 
 
 		 445 aa  156  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  31.98 
 
 		 450 aa  156  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  30.88 
 
 		 549 aa  156  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  30.92 
 
 		 549 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  31.15 
 
 		 560 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  30.79 
 
 		 541 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  30.68 
 
 		 550 aa  156  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  31.08 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  30.53 
 
 		 545 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  31.08 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  32.29 
 
 		 541 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  31.08 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0755  glucose-6-phosphate isomerase  29.53 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  30.28 
 
 		 549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  32.29 
 
 		 547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  30.48 
 
 		 545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  30.28 
 
 		 549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  30.91 
 
 		 545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  30.91 
 
 		 545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  29.96 
 
 		 545 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  30.25 
 
 		 545 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  31.37 
 
 		 550 aa  154  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  33.71 
 
 		 547 aa  154  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  33.7 
 
 		 468 aa  154  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  30.62 
 
 		 553 aa  154  5e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>