More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1008 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1008  Glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 553 aa  1097    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.6147  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  55.33 
 
 		 543 aa  553  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3338  Glucose-6-phosphate isomerase  54.64 
 
 		 554 aa  548  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  53.89 
 
 		 553 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  53.72 
 
 		 549 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  53.95 
 
 		 543 aa  542  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4334  glucose-6-phosphate isomerase  52.74 
 
 		 554 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  52.92 
 
 		 554 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4420  glucose-6-phosphate isomerase  52.74 
 
 		 554 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  53.27 
 
 		 649 aa  539  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  54.77 
 
 		 546 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  53.7 
 
 		 569 aa  536  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  54.58 
 
 		 546 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  53.76 
 
 		 543 aa  531  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7561  glucose-6-phosphate isomerase  54.02 
 
 		 545 aa  528  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  52.07 
 
 		 548 aa  531  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10963  glucose-6-phosphate isomerase  52.97 
 
 		 553 aa  530  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  52.48 
 
 		 570 aa  526  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1334  Glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 		 565 aa  527  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.994679  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05060  glucose-6-phosphate isomerase  51 
 
 		 552 aa  525  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0183  Glucose-6-phosphate isomerase  51.32 
 
 		 571 aa  521  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  52.24 
 
 		 539 aa  524  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  52.24 
 
 		 539 aa  524  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  53.83 
 
 		 550 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1311  Glucose-6-phosphate isomerase  53.41 
 
 		 560 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15279  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1463  glucose-6-phosphate isomerase  51.43 
 
 		 561 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11040  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 		 564 aa  511  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0493698  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0469  glucose-6-phosphate isomerase  50.84 
 
 		 546 aa  509  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0370  Glucose-6-phosphate isomerase  49.08 
 
 		 561 aa  502  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  47.22 
 
 		 547 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1025  glucose-6-phosphate isomerase  47.68 
 
 		 566 aa  499  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  46.21 
 
 		 562 aa  498  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7286  glucose-6-phosphate isomerase  53.25 
 
 		 570 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813116  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0343  glucose-6-phosphate isomerase  47.41 
 
 		 564 aa  501  1e-140  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1318  glucose-6-phosphate isomerase  46.87 
 
 		 568 aa  499  1e-140  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.321309 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  48.81 
 
 		 548 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  47.22 
 
 		 548 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  52.23 
 
 		 556 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  48.98 
 
 		 545 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  47.7 
 
 		 548 aa  490  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  47.69 
 
 		 549 aa  491  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  49.61 
 
 		 550 aa  487  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  50.19 
 
 		 551 aa  487  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  45.4 
 
 		 549 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  48.43 
 
 		 560 aa  483  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  47.41 
 
 		 547 aa  484  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  48.33 
 
 		 547 aa  482  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  47.32 
 
 		 548 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  45.21 
 
 		 548 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  45.21 
 
 		 548 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  45.21 
 
 		 548 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  44.58 
 
 		 550 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  46.49 
 
 		 552 aa  477  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  43.22 
 
 		 547 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 615 aa  478  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  44.48 
 
 		 549 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  45.21 
 
 		 549 aa  477  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  45.44 
 
 		 559 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  44.3 
 
 		 549 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  44.48 
 
 		 549 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  49.61 
 
 		 541 aa  472  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  44.4 
 
 		 549 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  44.48 
 
 		 549 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  48.64 
 
 		 547 aa  472  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  44.3 
 
 		 549 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  43.76 
 
 		 549 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 		 540 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 		 540 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  49.62 
 
 		 540 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  49.62 
 
 		 540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 		 540 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  50.1 
 
 		 541 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 		 540 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  46.17 
 
 		 550 aa  472  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  44.57 
 
 		 549 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 		 540 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  44.95 
 
 		 548 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  43.58 
 
 		 549 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  42.75 
 
 		 554 aa  466  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  43.58 
 
 		 549 aa  468  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  43.12 
 
 		 550 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  46.65 
 
 		 556 aa  467  9.999999999999999e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  43.58 
 
 		 549 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  43.86 
 
 		 549 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  45.6 
 
 		 549 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  52.13 
 
 		 547 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  43.48 
 
 		 549 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  43.48 
 
 		 549 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  43.58 
 
 		 549 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  43.04 
 
 		 549 aa  468  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  44.48 
 
 		 550 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  43.58 
 
 		 549 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  43.58 
 
 		 549 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  44.67 
 
 		 550 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  44.49 
 
 		 548 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  47.27 
 
 		 540 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  48.06 
 
 		 540 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  48.06 
 
 		 556 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  45.59 
 
 		 552 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  43.17 
 
 		 548 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>