More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3181 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
260 aa  532  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 
260 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.289001  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
260 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
257 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0187  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 
247 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
270 aa  168  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  35.66 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 
265 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  40 
 
 
255 aa  165  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
258 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
285 aa  162  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
268 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
257 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1837  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
258 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00311801  normal  0.334735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
250 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
255 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 
246 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 
246 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5688  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
260 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
256 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
262 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245464  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
262 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  35.89 
 
 
247 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
240 aa  156  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1839  glucose 1-dehydrogenase  35.34 
 
 
263 aa  155  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0372378  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0470  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.55 
 
 
249 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000863447  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
255 aa  155  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
259 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965402  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
257 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
259 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.191846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  35.6 
 
 
247 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2412  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.55 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
256 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0881608 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
248 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  34.27 
 
 
261 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  34.68 
 
 
261 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  34.68 
 
 
261 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  34.68 
 
 
261 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  34.27 
 
 
261 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.78 
 
 
247 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
249 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1661  glucose 1-dehydrogenase  33.85 
 
 
268 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218295  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
248 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.99 
 
 
249 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
287 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  35.08 
 
 
261 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
259 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0259011  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  38.04 
 
 
261 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
261 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1031  putative short-chain alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 
260 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.394755 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
269 aa  148  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  34.68 
 
 
261 aa  148  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  34.68 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  34.27 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  34.27 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 
260 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.37 
 
 
252 aa  146  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3400  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
262 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  normal  0.358288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
248 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
259 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
246 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
247 aa  145  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
247 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
249 aa  145  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  34.27 
 
 
261 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
246 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
249 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
249 aa  145  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.112645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
250 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0259595  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
252 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.6 
 
 
250 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
248 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
251 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.82 
 
 
246 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
248 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 
261 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
271 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.85 
 
 
247 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
271 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.0331692 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  33.6 
 
 
250 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
251 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
287 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
251 aa  143  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>