34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2759 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2759  hypothetical protein  100 
 
 		 681 aa  1361    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.172121  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3236  GAF domain-containing protein  24.14 
 
 		 578 aa  74.3  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  23 
 
 		 614 aa  72  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  21.64 
 
 		 631 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  32.22 
 
 		 741 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2359  putative phytochrome sensor protein  22.46 
 
 		 627 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2177  GAF domain-containing protein  24.28 
 
 		 611 aa  55.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2400  GAF domain-containing protein  20.65 
 
 		 628 aa  54.3  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  32.43 
 
 		 354 aa  51.2  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  26.25 
 
 		 711 aa  50.8  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  24.1 
 
 		 719 aa  50.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2601  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.5 
 
 		 440 aa  50.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.07 
 
 		 447 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0618  putative phytochrome sensor protein  23.19 
 
 		 615 aa  49.7  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  30.94 
 
 		 360 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  24.4 
 
 		 436 aa  49.3  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 		 360 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  27.08 
 
 		 714 aa  48.5  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.63 
 
 		 447 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.5 
 
 		 360 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  24.22 
 
 		 439 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  22.94 
 
 		 448 aa  47  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  25.7 
 
 		 407 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0669  hypothetical protein  23.2 
 
 		 439 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  28.78 
 
 		 367 aa  45.8  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.86 
 
 		 416 aa  44.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3658  multidrug resistance efflux pump  24.81 
 
 		 343 aa  45.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.48 
 
 		 409 aa  44.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.94 
 
 		 380 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0146  hypothetical protein  24.54 
 
 		 439 aa  44.3  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.47 
 
 		 480 aa  44.3  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  25 
 
 		 442 aa  44.3  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  26.63 
 
 		 715 aa  43.9  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000654  putative efflux protein  24.28 
 
 		 360 aa  43.9  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>