More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2694 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 288 aa  598  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  77.37 
 
 		 284 aa  448  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  74.11 
 
 		 293 aa  448  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  74.56 
 
 		 291 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  74.02 
 
 		 290 aa  444  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.18 
 
 		 291 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  75.89 
 
 		 291 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.29 
 
 		 293 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.37 
 
 		 291 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  72.82 
 
 		 291 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  71.99 
 
 		 292 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  73.4 
 
 		 291 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  72.4 
 
 		 283 aa  427  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.56 
 
 		 294 aa  424  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  70.57 
 
 		 304 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  72.14 
 
 		 292 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  72.24 
 
 		 293 aa  421  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  70.57 
 
 		 291 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  70.92 
 
 		 286 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  69.4 
 
 		 282 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  70.92 
 
 		 290 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  69.64 
 
 		 279 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  70.71 
 
 		 279 aa  417  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  69.15 
 
 		 280 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  69.96 
 
 		 293 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  69.96 
 
 		 293 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  70.57 
 
 		 290 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  70.46 
 
 		 290 aa  413  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  67.62 
 
 		 280 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  68.68 
 
 		 289 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  69.86 
 
 		 290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  68.93 
 
 		 279 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  67.62 
 
 		 279 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  69.26 
 
 		 292 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  67.86 
 
 		 280 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  70.76 
 
 		 291 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  68.44 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  68.44 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  67.26 
 
 		 279 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  68.44 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  68.44 
 
 		 288 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  68.79 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  68.44 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  68.44 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  68.44 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  68.44 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  67.14 
 
 		 286 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  67.02 
 
 		 288 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  66.31 
 
 		 288 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  65.96 
 
 		 288 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.453629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  66.31 
 
 		 288 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  67.72 
 
 		 289 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  66.31 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  65.05 
 
 		 298 aa  391  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.62 
 
 		 279 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  63.99 
 
 		 285 aa  385  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  65.61 
 
 		 284 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  65.61 
 
 		 284 aa  381  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  65.61 
 
 		 283 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  65.36 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  62.82 
 
 		 290 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  63.35 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  60.14 
 
 		 285 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  63.6 
 
 		 285 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  63.08 
 
 		 288 aa  362  5.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  60.84 
 
 		 289 aa  361  8e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  61.48 
 
 		 285 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.05 
 
 		 289 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.5 
 
 		 286 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  62.86 
 
 		 289 aa  352  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  60.98 
 
 		 290 aa  337  1.9999999999999998e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  63.22 
 
 		 280 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  63.85 
 
 		 280 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  55.98 
 
 		 283 aa  289  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  58.2 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  45 
 
 		 233 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  43.04 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  43.1 
 
 		 255 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  44.09 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  44.39 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.55 
 
 		 208 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  42.98 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  40.25 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.86 
 
 		 230 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  43.64 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  40.34 
 
 		 234 aa  168  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.8 
 
 		 232 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  45.19 
 
 		 233 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  43.93 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  41.67 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  41.67 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  43.78 
 
 		 230 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  41.57 
 
 		 362 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.23 
 
 		 233 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  43.32 
 
 		 236 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  41.94 
 
 		 230 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4017  glutathione S-transferase-like  42.53 
 
 		 234 aa  165  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  42.2 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  40.44 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  43.19 
 
 		 213 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>