34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1622 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  763    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  59.88 
 
 		 363 aa  438  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  53.76 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  51.58 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  51.28 
 
 		 370 aa  364  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  49.86 
 
 		 369 aa  355  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  48.28 
 
 		 372 aa  353  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  39.48 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  37.85 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  37.85 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  37.85 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  37.85 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  37.85 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  38.31 
 
 		 306 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  36.86 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  37.18 
 
 		 327 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  36.54 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  36.54 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  36.54 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  38.24 
 
 		 408 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  37.5 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  25.9 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  28.68 
 
 		 378 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  26.58 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  23.64 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  27.08 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  23.64 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  24.26 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  23.16 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4508  hypothetical protein  26.02 
 
 		 422 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1906  hypothetical protein  23.02 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  22.14 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  30.49 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  25.81 
 
 		 353 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>