More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1483 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  203  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  62.75 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 104 aa  115  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  56.86 
 
 		 223 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 188 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  50.49 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 157 aa  103  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  53.85 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  51.92 
 
 		 171 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  47.96 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  49.51 
 
 		 221 aa  97.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  47.96 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  47.96 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  95.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  47.96 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  43.88 
 
 		 105 aa  95.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  50.49 
 
 		 258 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  57.43 
 
 		 230 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  47.96 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  47.96 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  47.96 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  49.51 
 
 		 198 aa  95.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  47.96 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  47.96 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  47.96 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  47.96 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  51.46 
 
 		 101 aa  94.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  48.08 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  49.45 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  46.6 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 224 aa  92  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 104 aa  90.5  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 102 aa  90.1  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 138 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>