75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1171 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1171  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.51603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0127  hypothetical protein  72.49 
 
 		 269 aa  421  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0384146  hitchhiker  0.00530729 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0135  hypothetical protein  65.67 
 
 		 269 aa  383  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0102  hypothetical protein  61.94 
 
 		 270 aa  349  2e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000654219 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0757  periplasmic binding protein  44.98 
 
 		 273 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1584  periplasmic binding protein  32.47 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.409039  normal  0.308354 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2214  periplasmic binding protein  30.74 
 
 		 264 aa  85.5  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1104  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  31.25 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  24.12 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2093  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  29.17 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.839257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  29.13 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2762  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.599111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2460  periplasmic binding protein  26.58 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2169  periplasmic binding protein  30.09 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000287241  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  23.16 
 
 		 320 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  23.16 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.59 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1056  hypothetical protein  26.15 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1739  periplasmic binding protein  27.65 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.102964  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  23.16 
 
 		 320 aa  48.9  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  28.79 
 
 		 379 aa  48.9  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3846  periplasmic binding protein  28.69 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.907593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  23.12 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.79 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  23.12 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.79 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1393  periplasmic binding protein  29.03 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310826  normal  0.0475326 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  24.44 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.79 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.79 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.79 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  24.44 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.79 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  29.2 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  25.58 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  24.44 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  32.29 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  22.03 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2443  periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000910512  normal  0.674129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  24.1 
 
 		 309 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  22.6 
 
 		 320 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  27.97 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2146  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  26.52 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.543136  normal  0.254057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0184  periplasmic binding protein  30.09 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  21.47 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11530  hypothetical protein  25.81 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.78 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  24.6 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  28 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  21.74 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  28.83 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0469  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69845 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  31.48 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  31.58 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  21.74 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2782  periplasmic binding protein  23.26 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  34.29 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  22.47 
 
 		 320 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.14 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  24.14 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  23.48 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  27.5 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  21.5 
 
 		 339 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.27 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1518  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 315 aa  42.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  29.07 
 
 		 331 aa  42.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.45 
 
 		 311 aa  42.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2167  periplasmic binding protein  23.84 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579619  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4249  iron ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.93 
 
 		 272 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>