More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1168 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1168  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
321 aa  639    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.376833  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0120  aminotransferase, class I and II  63.32 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0089  histidinol phosphate aminotransferase  62.65 
 
 
333 aa  369  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00200797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  30.58 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  29.81 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  29.91 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  29.17 
 
 
358 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1656  histidinol-phosphate aminotransferase  28.98 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.532506  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  30.03 
 
 
358 aa  119  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  30.72 
 
 
350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  29.43 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  29.43 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  29.73 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  31.82 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  32.75 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  29.5 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  31.82 
 
 
356 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  32.75 
 
 
359 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  31.07 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  30.84 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  31.07 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  31.82 
 
 
356 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  32.4 
 
 
359 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  32.4 
 
 
359 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  31.82 
 
 
356 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1942  histidinol phosphate aminotransferase  30.4 
 
 
391 aa  109  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.95238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  31.47 
 
 
356 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  32.06 
 
 
359 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  31.53 
 
 
360 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  28.82 
 
 
353 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  31.47 
 
 
356 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1263  histidinol-phosphate aminotransferase  31.65 
 
 
348 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.136203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  28.22 
 
 
351 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  28.88 
 
 
360 aa  105  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  29.88 
 
 
357 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
371 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  29.73 
 
 
350 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  26.17 
 
 
395 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  29.06 
 
 
351 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  30.07 
 
 
353 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  28.01 
 
 
355 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1410  aminotransferase class I and II  27.92 
 
 
353 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  28.87 
 
 
382 aa  103  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 
355 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  30.24 
 
 
362 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  28.75 
 
 
356 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  29.59 
 
 
357 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  29.48 
 
 
355 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  29.48 
 
 
355 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  28.79 
 
 
355 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 
382 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
348 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  28.44 
 
 
357 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  29.57 
 
 
371 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
353 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  31.59 
 
 
355 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 
382 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  29.36 
 
 
356 aa  99.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  28.44 
 
 
369 aa  99.4  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  29.94 
 
 
355 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  25.76 
 
 
350 aa  99  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  30.12 
 
 
356 aa  98.2  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  31.08 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  27.71 
 
 
357 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  29.94 
 
 
387 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  30.88 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  30.09 
 
 
352 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  30.24 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  27.03 
 
 
356 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  28.96 
 
 
355 aa  97.1  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  28.28 
 
 
348 aa  96.7  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  28.87 
 
 
362 aa  96.7  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  29.17 
 
 
354 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  28.27 
 
 
350 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  27.27 
 
 
350 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  30.98 
 
 
367 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  27.08 
 
 
370 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  28.75 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  28.79 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  26.57 
 
 
358 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  29.17 
 
 
351 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  29.32 
 
 
374 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  27.06 
 
 
356 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  30.43 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  28.24 
 
 
367 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 
357 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4103  histidinol phosphate aminotransferase  29.11 
 
 
347 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 
357 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 
357 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 
356 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  30.58 
 
 
360 aa  93.6  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  28.4 
 
 
371 aa  93.2  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1012  histidinol phosphate aminotransferase  28.57 
 
 
356 aa  92.8  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723593  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  27.94 
 
 
356 aa  92.4  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  28.27 
 
 
351 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  30.23 
 
 
355 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11616  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 
380 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  27.22 
 
 
353 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>