More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0089 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0089  histidinol phosphate aminotransferase  100 
 
 
333 aa  666    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00200797 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0120  aminotransferase, class I and II  79.5 
 
 
338 aa  513  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1168  aminotransferase, class I and II  62.65 
 
 
321 aa  403  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.376833  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1942  histidinol phosphate aminotransferase  34.95 
 
 
391 aa  155  8e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.95238 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1656  histidinol-phosphate aminotransferase  32.12 
 
 
376 aa  147  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.532506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 
371 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  30.24 
 
 
351 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 
366 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  30.82 
 
 
358 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  31.44 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.54 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  31.27 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 
350 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  30.93 
 
 
348 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  30.84 
 
 
348 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  29.82 
 
 
358 aa  123  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  30.09 
 
 
358 aa  123  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  28.01 
 
 
350 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  32.62 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  29.73 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  28.4 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  32.83 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  31.25 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  30.38 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  30.28 
 
 
348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 
350 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  28.49 
 
 
369 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  28.78 
 
 
357 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  30.88 
 
 
355 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  30.88 
 
 
355 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  30.84 
 
 
358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  31.18 
 
 
371 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1768  histidinol-phosphate aminotransferase  31.23 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  27.54 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  32.86 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  30.56 
 
 
357 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  30.47 
 
 
357 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  29.57 
 
 
383 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  31.27 
 
 
351 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  32.26 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  28.61 
 
 
353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  30.29 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  30.12 
 
 
387 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  30.54 
 
 
350 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  26.25 
 
 
353 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  29.03 
 
 
399 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  27.81 
 
 
356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  28.92 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  28.82 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.09 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  31.23 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1710  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1012  histidinol phosphate aminotransferase  31.09 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723593  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  29.2 
 
 
370 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  30.81 
 
 
355 aa  109  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
370 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
370 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  28.95 
 
 
367 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  32.94 
 
 
365 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  31.14 
 
 
367 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 
357 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  30.67 
 
 
356 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  24.71 
 
 
354 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  28.36 
 
 
370 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  30.29 
 
 
355 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  31.04 
 
 
355 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  28.74 
 
 
370 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  30.36 
 
 
364 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  28.3 
 
 
348 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  29.5 
 
 
354 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  28.3 
 
 
348 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  28.65 
 
 
370 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  30.36 
 
 
364 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1902  histidinol-phosphate aminotransferase  29.31 
 
 
352 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  32.15 
 
 
363 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  28.36 
 
 
370 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  28.36 
 
 
370 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  28.36 
 
 
370 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  28.36 
 
 
370 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1410  aminotransferase class I and II  27.89 
 
 
353 aa  106  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  30.24 
 
 
355 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1900  histidinol-phosphate aminotransferase  30.32 
 
 
387 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1344  histidinol-phosphate aminotransferase  31.34 
 
 
364 aa  105  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453869  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1263  histidinol-phosphate aminotransferase  31.34 
 
 
348 aa  105  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.136203  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  31.74 
 
 
363 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  29.8 
 
 
356 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  28.79 
 
 
357 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  29.74 
 
 
357 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  29.74 
 
 
356 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  30.32 
 
 
371 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  30.87 
 
 
351 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  29.74 
 
 
357 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  29.74 
 
 
357 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  29.94 
 
 
357 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  29.65 
 
 
356 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4228  aminotransferase class I and II  31.45 
 
 
347 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  29.38 
 
 
370 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  29.91 
 
 
371 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>