More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2332 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2332  ABC transporter ATP-binding and permease protein  100 
 
 		 593 aa  1208    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  35.02 
 
 		 625 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  34.07 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  35.57 
 
 		 602 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  34.34 
 
 		 603 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  34.18 
 
 		 602 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  36.72 
 
 		 621 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  34.94 
 
 		 611 aa  365  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  34.14 
 
 		 614 aa  363  7.0000000000000005e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  35.91 
 
 		 611 aa  360  3e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  35.48 
 
 		 613 aa  359  9e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.48 
 
 		 592 aa  355  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  35.01 
 
 		 619 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  34.91 
 
 		 608 aa  353  5e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  37.41 
 
 		 600 aa  349  9e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  33.92 
 
 		 616 aa  348  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  36 
 
 		 603 aa  347  4e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  33.22 
 
 		 586 aa  346  7e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  31.89 
 
 		 635 aa  343  5e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  34.28 
 
 		 588 aa  341  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  33.05 
 
 		 607 aa  339  5.9999999999999996e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  33.91 
 
 		 611 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  35.29 
 
 		 587 aa  336  5.999999999999999e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  34.45 
 
 		 600 aa  335  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  33.56 
 
 		 588 aa  332  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  32.29 
 
 		 589 aa  331  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  34.07 
 
 		 610 aa  329  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  31.99 
 
 		 622 aa  327  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  33.39 
 
 		 592 aa  325  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  33.28 
 
 		 584 aa  324  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  32.46 
 
 		 591 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  33.33 
 
 		 609 aa  319  7.999999999999999e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  34.32 
 
 		 608 aa  316  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  36 
 
 		 610 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  32.6 
 
 		 610 aa  315  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  38.23 
 
 		 610 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  31.27 
 
 		 588 aa  311  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  36.49 
 
 		 650 aa  311  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  32.3 
 
 		 642 aa  310  5e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  32.93 
 
 		 594 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  31.72 
 
 		 637 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  31.46 
 
 		 602 aa  308  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  32.98 
 
 		 590 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  32.35 
 
 		 587 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.35 
 
 		 587 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  32.35 
 
 		 587 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  32.35 
 
 		 587 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.64 
 
 		 587 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.35 
 
 		 587 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  31.44 
 
 		 598 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  34.64 
 
 		 598 aa  303  6.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.52 
 
 		 587 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  33.33 
 
 		 626 aa  303  8.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  32.12 
 
 		 587 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 600 aa  302  9e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  31.2 
 
 		 617 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  32.12 
 
 		 587 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  31.4 
 
 		 632 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  32.51 
 
 		 587 aa  300  7e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  34.13 
 
 		 626 aa  299  9e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  35 
 
 		 622 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  31.26 
 
 		 632 aa  299  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  31.76 
 
 		 603 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3126  ABC transporter related  35.32 
 
 		 592 aa  297  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.43 
 
 		 578 aa  296  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  32.75 
 
 		 592 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  32.67 
 
 		 592 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.23 
 
 		 597 aa  295  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  28.1 
 
 		 571 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  30.93 
 
 		 609 aa  294  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.21 
 
 		 598 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  30 
 
 		 600 aa  293  8e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.51 
 
 		 598 aa  292  9e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  29.85 
 
 		 623 aa  292  9e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  32.65 
 
 		 586 aa  293  9e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  31.24 
 
 		 579 aa  292  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  31.94 
 
 		 587 aa  292  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.85 
 
 		 598 aa  292  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.27 
 
 		 587 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  31.01 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  29.95 
 
 		 582 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.5 
 
 		 602 aa  291  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  30.85 
 
 		 620 aa  290  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.68 
 
 		 578 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.68 
 
 		 578 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.67 
 
 		 598 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.68 
 
 		 589 aa  289  8e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  33.79 
 
 		 606 aa  289  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  32.51 
 
 		 598 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  32.07 
 
 		 584 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.92 
 
 		 597 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  30.94 
 
 		 618 aa  287  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  30.12 
 
 		 594 aa  286  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  31.42 
 
 		 605 aa  286  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  31.05 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.05 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.05 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.05 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  31.53 
 
 		 592 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.85 
 
 		 580 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>