248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4029 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  100 
 
 
251 aa  510  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  38.78 
 
 
243 aa  165  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  35.08 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  36.43 
 
 
268 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  36.16 
 
 
244 aa  141  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  36.14 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3272  pantothenate kinase  36.89 
 
 
235 aa  133  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  34.01 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  30.56 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  30.08 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  30.86 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  30.31 
 
 
262 aa  92  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  29.41 
 
 
262 aa  92  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  29.53 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  29.53 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  29.53 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  29.53 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  29.53 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  29.53 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  28.4 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  29.53 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.63 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  29.61 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  29.53 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  28.79 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  29.46 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.54 
 
 
241 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  33.54 
 
 
241 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  27.38 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  27.31 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  30.15 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  29.77 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  31.1 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1518  pantothenate kinase  26.59 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.4 
 
 
253 aa  82  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.29 
 
 
257 aa  82  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  30.71 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  27.63 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  26.27 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  28.79 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  30.11 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.68 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  30.36 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0424  Baf family transcriptional activator  29.39 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00396752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  29.5 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  27.67 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  27.67 
 
 
257 aa  79  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  28.63 
 
 
264 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  28.35 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  28.19 
 
 
263 aa  79  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.58 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  30.36 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  27.41 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  28.06 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  28.86 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  30.43 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  27.97 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  28.91 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  29.73 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  26.52 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  33.53 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  25.96 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  28.76 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  27.27 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  26.17 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  25.37 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3611  Baf family transcriptional activator  28.41 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  27.62 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  28.12 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  27.41 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9156  pantothenate kinase  24.81 
 
 
260 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166595  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  27.43 
 
 
255 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.11 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  27.69 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.69 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  27.67 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0238  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.29 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  27.91 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  23.4 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  26.85 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  25.66 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  24.23 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  27.85 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  31.85 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  26.64 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  21.97 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  25.66 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.3 
 
 
263 aa  72  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  26.85 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  30.38 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  26.24 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  31.85 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  30.06 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  33.48 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  26.27 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  25.3 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  25.3 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  28.27 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.27 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  26.27 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.216883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>