26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3121 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3121  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 105 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1818  helix-turn-helix domain protein  45.1 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0350108  decreased coverage  0.0000000000623016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0914  helix-turn-helix domain protein  43.69 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0680459  hitchhiker  0.00000175026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1997  helix-turn-helix domain protein  45 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285438  hitchhiker  0.000964376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  46 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2266  helix-turn-helix domain protein  39.6 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0639842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3951  helix-turn-helix domain protein  39.81 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1142  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343255  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  39.68 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9645  hypothetical protein  33.93 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.085349  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0620  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.855265  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4238  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0673449  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0670  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000580347  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  30.1 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 240 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0845  helix-turn-helix domain-containing protein  29.35 
 
 		 188 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000284644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1934  DNA-binding protein  28.09 
 
 		 179 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  28.09 
 
 		 179 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 334 aa  41.2  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  42.59 
 
 		 264 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  26.26 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  23.4 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>