More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3024 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3024  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 393 aa  814    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.418532  normal  0.0482136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3795  tryptophan synthase subunit beta  75.45 
 
 		 399 aa  628  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4896  tryptophan synthase subunit beta  73.79 
 
 		 393 aa  628  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.541071  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5479  tryptophan synthase, beta subunit  74.36 
 
 		 399 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1827  tryptophan synthase subunit beta  73.64 
 
 		 408 aa  622  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06380  tryptophan synthase beta chain  72.56 
 
 		 397 aa  616  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.211017  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3296  tryptophan synthase subunit beta  73.2 
 
 		 398 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  63.19 
 
 		 389 aa  494  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  63.19 
 
 		 389 aa  494  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  61.3 
 
 		 404 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 		 396 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 411 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 401 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  57.54 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0491  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  57.54 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  58.82 
 
 		 409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  58.51 
 
 		 409 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  58.84 
 
 		 397 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 417 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  58.66 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 404 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  60.16 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  59.11 
 
 		 399 aa  464  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0827  tryptophan synthase subunit beta  59.44 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 412 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 393 aa  466  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  58.73 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  56.63 
 
 		 413 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1297  tryptophan synthase subunit beta  59.44 
 
 		 399 aa  461  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.311384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  56.06 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 403 aa  461  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  57.93 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  56.63 
 
 		 413 aa  461  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 409 aa  463  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 416 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  58.73 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 399 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0673  tryptophan synthase subunit beta  58.93 
 
 		 400 aa  459  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355692 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 399 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  58.03 
 
 		 420 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  57.85 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 400 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  59.58 
 
 		 434 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 		 411 aa  459  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  58.08 
 
 		 397 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  57.84 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  58.06 
 
 		 418 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 403 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  59.07 
 
 		 403 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 398 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2592  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 422 aa  455  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  56.38 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 391 aa  455  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1943  tryptophan synthase subunit beta  59.44 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.233821  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  56.49 
 
 		 414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  58.91 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 393 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 396 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3239  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  57.69 
 
 		 402 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  57.69 
 
 		 402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  56.54 
 
 		 406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>