67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1886 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  100 
 
 		 637 aa  1323    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0511  hypothetical protein  35.06 
 
 		 635 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  35.28 
 
 		 632 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  32.27 
 
 		 636 aa  346  7e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 621 aa  340  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  32.43 
 
 		 642 aa  327  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  22.86 
 
 		 1225 aa  124  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  22.4 
 
 		 664 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1096 aa  87  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.96 
 
 		 1256 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.74 
 
 		 1256 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  20.95 
 
 		 1256 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  22.07 
 
 		 659 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  23.23 
 
 		 621 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  23.23 
 
 		 621 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  27.8 
 
 		 647 aa  72.8  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  29.82 
 
 		 639 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  30.52 
 
 		 634 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  30.52 
 
 		 634 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  25 
 
 		 641 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  23.73 
 
 		 647 aa  70.1  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  32.89 
 
 		 616 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  28.81 
 
 		 635 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  28.65 
 
 		 637 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  22.8 
 
 		 1257 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  30.07 
 
 		 638 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  30.07 
 
 		 638 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  28 
 
 		 632 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  26.18 
 
 		 633 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  22.68 
 
 		 636 aa  62  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  26.54 
 
 		 637 aa  62.4  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  23.42 
 
 		 633 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  26.54 
 
 		 637 aa  62.4  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  20 
 
 		 753 aa  61.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  22.68 
 
 		 636 aa  61.6  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 1253 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  23.28 
 
 		 667 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  24.48 
 
 		 898 aa  57.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1338 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  22.6 
 
 		 613 aa  55.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  22.6 
 
 		 613 aa  55.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1433 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  21.49 
 
 		 672 aa  54.7  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  20.24 
 
 		 647 aa  54.3  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  20.24 
 
 		 647 aa  54.3  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  24.1 
 
 		 672 aa  53.9  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  25.79 
 
 		 1431 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1028 aa  52  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0260  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1241 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379172  normal  0.583733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  22.32 
 
 		 840 aa  51.6  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1433 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  22.97 
 
 		 658 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  22.04 
 
 		 673 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  23.16 
 
 		 673 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  28.76 
 
 		 665 aa  48.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  26.97 
 
 		 342 aa  47.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  21.36 
 
 		 1042 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  26.47 
 
 		 626 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  25.58 
 
 		 634 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  25.88 
 
 		 588 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  26.47 
 
 		 632 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  26.47 
 
 		 629 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  26.63 
 
 		 626 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  26.63 
 
 		 626 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1887  transglutaminase domain protein  19.74 
 
 		 656 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0540  hypothetical protein  19.53 
 
 		 655 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920015  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3999  hypothetical protein  31 
 
 		 672 aa  43.9  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.153544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>