More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1609 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1609  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 349 aa  718    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00228906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4776  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  66.96 
 
 		 355 aa  455  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.437882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  45.03 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  44.55 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  41.58 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  41.58 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  40.92 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  43.05 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  43.23 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  39.29 
 
 		 304 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  42.62 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  42.21 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  42.14 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  38.83 
 
 		 307 aa  205  8e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  42.47 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  40.65 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  38.19 
 
 		 311 aa  202  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  42.62 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  40.72 
 
 		 307 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  40.07 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  39.14 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  40.07 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  38.16 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  37.96 
 
 		 387 aa  199  7e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  39.08 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  41.78 
 
 		 304 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  42.16 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  38.28 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  42.11 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  41.02 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  40.26 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  36.47 
 
 		 349 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0955  cysteine synthase A  44.55 
 
 		 305 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  41.45 
 
 		 300 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  41.14 
 
 		 301 aa  195  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  36.56 
 
 		 349 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  39.27 
 
 		 317 aa  195  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  41.04 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  40.46 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  39.6 
 
 		 304 aa  195  1e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  38.22 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  39.02 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  36.47 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  40.58 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  39.6 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  40.39 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  40.39 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  40.39 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  41.69 
 
 		 307 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  40.39 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  41.04 
 
 		 307 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  37.7 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  40.39 
 
 		 307 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  38.34 
 
 		 318 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  39.42 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  40.07 
 
 		 307 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  39.29 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  40.39 
 
 		 307 aa  192  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  39.81 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  42.11 
 
 		 308 aa  192  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  40 
 
 		 307 aa  192  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  39.29 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  38.69 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  40.33 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  39.29 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  38.69 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  38.69 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  38.69 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  38.69 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  37.17 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  38.69 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  38.69 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  38.69 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  38.98 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  39.29 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  38.96 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  41.23 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  42.37 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  38.96 
 
 		 305 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  38.96 
 
 		 305 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  39.74 
 
 		 307 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  41.64 
 
 		 311 aa  189  9e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  38.96 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1480  cysteine synthase A  41.67 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  38.96 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  39.29 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0952  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.31 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  38.96 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  41.31 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  37.95 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  39.8 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  38.36 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  38.36 
 
 		 303 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  38.69 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  40.98 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2304  cysteine synthase  40.89 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0463  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.66 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  38.03 
 
 		 303 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  38.69 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  43.42 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>