30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1059 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1059  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1068  hypothetical protein  51.46 
 
 
252 aa  208  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1054  hypothetical protein  45.02 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.52466  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1062  hypothetical protein  51.07 
 
 
329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1067  hypothetical protein  52.58 
 
 
322 aa  189  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1056  hypothetical protein  53.55 
 
 
317 aa  186  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1064  hypothetical protein  50.7 
 
 
399 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1061  hypothetical protein  44.8 
 
 
301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1057  hypothetical protein  49.32 
 
 
327 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1063  hypothetical protein  73.39 
 
 
316 aa  177  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1066  hypothetical protein  72.73 
 
 
287 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1055  hypothetical protein  69.11 
 
 
310 aa  171  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1060  hypothetical protein  76.64 
 
 
278 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1058  hypothetical protein  71.68 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1065  hypothetical protein  46.82 
 
 
343 aa  152  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0300  hypothetical protein  42.86 
 
 
334 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2510  hypothetical protein  36.32 
 
 
385 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5413  hypothetical protein  48.36 
 
 
318 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4639  hypothetical protein  45.08 
 
 
324 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4274  hypothetical protein  47.54 
 
 
326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3187  hypothetical protein  43.12 
 
 
376 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5318  hypothetical protein  50 
 
 
585 aa  95.5  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605943  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3213  cell wall anchor protein  35.12 
 
 
362 aa  94.4  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205572  normal  0.0928612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4924  hypothetical protein  46 
 
 
513 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967117  normal  0.381543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3214  hypothetical protein  46.6 
 
 
484 aa  90.1  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0127086  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0716  hypothetical protein  48.19 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112305  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3800  hypothetical protein  50 
 
 
515 aa  82.8  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445547  normal  0.2386 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  35.96 
 
 
918 aa  76.3  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  33.33 
 
 
781 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  27.61 
 
 
1168 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>