30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1056 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1056  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  645    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1054  hypothetical protein  46.05 
 
 
299 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.52466  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1064  hypothetical protein  43.97 
 
 
399 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1057  hypothetical protein  41.14 
 
 
327 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1068  hypothetical protein  54.59 
 
 
252 aa  192  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1059  hypothetical protein  54.98 
 
 
234 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1061  hypothetical protein  42.99 
 
 
301 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1067  hypothetical protein  85.71 
 
 
322 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1060  hypothetical protein  53.81 
 
 
278 aa  178  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1062  hypothetical protein  74.79 
 
 
329 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1066  hypothetical protein  77.68 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1065  hypothetical protein  40.06 
 
 
343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1058  hypothetical protein  72.58 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1063  hypothetical protein  77.57 
 
 
316 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1055  hypothetical protein  40.57 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0300  hypothetical protein  36.95 
 
 
334 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2510  hypothetical protein  31.56 
 
 
385 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4639  hypothetical protein  56 
 
 
324 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4274  hypothetical protein  53.15 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3213  cell wall anchor protein  33.44 
 
 
362 aa  112  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205572  normal  0.0928612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5413  hypothetical protein  53.77 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3187  hypothetical protein  44.92 
 
 
376 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5318  hypothetical protein  38.03 
 
 
585 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605943  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  39.84 
 
 
918 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0716  hypothetical protein  50.62 
 
 
338 aa  89.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112305  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3214  hypothetical protein  48.42 
 
 
484 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0127086  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3800  hypothetical protein  36.88 
 
 
515 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445547  normal  0.2386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4924  hypothetical protein  43.62 
 
 
513 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967117  normal  0.381543 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  38.94 
 
 
781 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  29.81 
 
 
1168 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>