More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0415 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0415  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  875    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0847  seryl-tRNA synthetase  65.01 
 
 		 423 aa  575  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5630  seryl-tRNA synthetase  67.45 
 
 		 423 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00319039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0734  seryl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 423 aa  565  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0216  seryl-tRNA synthetase  62.8 
 
 		 424 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03775  seryl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 423 aa  553  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.64354  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3604  seryl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 423 aa  549  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0316  seryl-tRNA synthetase  61.23 
 
 		 423 aa  536  1e-151  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.317147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3818  seryl-tRNA synthetase  63.95 
 
 		 430 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0225862  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1519  hypothetical protein  56.5 
 
 		 434 aa  491  9.999999999999999e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.833428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1968  seryl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 426 aa  448  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.355575  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2731  seryl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104172 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 421 aa  365  1e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 422 aa  363  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0594  seryl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 430 aa  361  2e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 427 aa  359  6e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 424 aa  356  5e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 452 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 423 aa  353  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 425 aa  351  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 427 aa  349  4e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 420 aa  349  6e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 424 aa  349  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  348  7e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 422 aa  348  8e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0695  seryl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0194542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0953  seryl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 468 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 423 aa  346  4e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 423 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 439 aa  345  6e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 431 aa  346  6e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1823  seryl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 427 aa  345  8e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 438 aa  344  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 424 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 431 aa  344  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 424 aa  343  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 430 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 432 aa  342  8e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 424 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 424 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3335  seryl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 444 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 423 aa  340  2e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 422 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3651  seryl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 438 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0461818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 425 aa  340  4e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 423 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 427 aa  339  5e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 422 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 425 aa  339  5.9999999999999996e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 424 aa  338  7e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0931  seryl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 431 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  43.71 
 
 		 427 aa  336  5e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 424 aa  336  5.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2772  seryl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 442 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 422 aa  335  9e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3445  seryl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 442 aa  335  9e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4028  seryl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 428 aa  333  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 423 aa  333  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0628  seryl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0256221  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1756  seryl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 414 aa  332  5e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl017  seryl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 422 aa  332  7.000000000000001e-90  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 426 aa  331  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>