More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1973 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1973  general secretion pathway protein G  100 
 
 		 142 aa  287  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3423  general secretion pathway protein G  83.22 
 
 		 169 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2339  general secretion pathway protein G  84.4 
 
 		 141 aa  209  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2792  general secretion pathway protein G  82.27 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.533388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2517  general secretion pathway protein G  82.98 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  0.111432 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  71.54 
 
 		 154 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28620  General secretion pathway protein G  76.06 
 
 		 142 aa  195  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  64.29 
 
 		 209 aa  191  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  69.47 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  65.38 
 
 		 166 aa  189  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  65.67 
 
 		 155 aa  187  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  62.22 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  65.15 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  65.15 
 
 		 153 aa  186  9e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  61.76 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1293  tyep II secretion system protein G  69.47 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.138374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2421  general secretion pathway protein G  69.7 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  55.56 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  52.48 
 
 		 146 aa  153  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  52.55 
 
 		 145 aa  150  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  52.63 
 
 		 151 aa  150  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  48.95 
 
 		 143 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  51.11 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  47.55 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  48.94 
 
 		 144 aa  139  9e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  48.18 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  48.15 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  48.15 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  46.21 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  46.53 
 
 		 154 aa  136  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  45.64 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  49.26 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  47.14 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  48.57 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  45.07 
 
 		 144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  47.76 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  46.81 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  48.91 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  45.8 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  44.78 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  46.27 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  46.76 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2893  general secretion pathway protein G  54.29 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.21869  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  46.21 
 
 		 164 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  44.12 
 
 		 163 aa  129  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  45.45 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  46.1 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  43.06 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  43.66 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  46.1 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  46.1 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  46.1 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  46.1 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  46.1 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  45.14 
 
 		 148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  47.76 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0686  general secretion pathway protein G  52.99 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0282491 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  47.06 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  46.1 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  42.96 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  44.52 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  43.84 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  44.14 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  43.36 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  44.53 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  45.39 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  46.67 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  46.67 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  45.71 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  42.07 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  42.76 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  45.71 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  45.86 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  46.1 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  42.66 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  43.88 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  44.2 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1528  general secretion pathway protein G  54.17 
 
 		 142 aa  123  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.430889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  44.83 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  45.11 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  47.01 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  46.38 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  46.21 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0883  general secretion pathway protein G  44.2 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  42.75 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  43.57 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  43.88 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  45.52 
 
 		 139 aa  121  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  43.88 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  43.88 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  43.88 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  44.85 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  42.45 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  42.45 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  43.48 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  43.48 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  42.45 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  48.15 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>