39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1964 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  100 
 
 		 138 aa  264  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0240  hypothetical protein  65.32 
 
 		 145 aa  146  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  55.38 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  55.38 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  55.38 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  57.76 
 
 		 137 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  36.89 
 
 		 137 aa  84.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  34.45 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  36.36 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  34.96 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  33.33 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4101  DoxX family protein  37.5 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  32.52 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  35.94 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  34.59 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  26.72 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0824  DoxX family protein  33.33 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0639123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  37.88 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  34.59 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  34.85 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  36.43 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  34.34 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  35.16 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  29.55 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  37.23 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  33.33 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  34.62 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  35.05 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  32.69 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  31.73 
 
 		 171 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  33.07 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  30.77 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  33.33 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  34.26 
 
 		 156 aa  40.8  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  31.88 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  32.61 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  34.56 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  28.12 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  34.56 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>