32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1738 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  100 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  83.21 
 
 		 268 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  67.07 
 
 		 266 aa  361  8e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  65.06 
 
 		 272 aa  361  8e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  65.56 
 
 		 273 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  67.89 
 
 		 266 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  66.67 
 
 		 266 aa  354  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  65.85 
 
 		 266 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  63.49 
 
 		 269 aa  343  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  64.44 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  45.59 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  43.45 
 
 		 277 aa  215  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  43.54 
 
 		 278 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  43.54 
 
 		 278 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  44.4 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  43.54 
 
 		 278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  43.19 
 
 		 295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  43.66 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3894  hypothetical protein  43.08 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4008  hypothetical protein  43.08 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  39.41 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4636  putative cytochrome c  40.7 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  27.71 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  25.52 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  25.11 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 388 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  26.11 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1845  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.75 
 
 		 349 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  30.95 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  28.68 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  26.14 
 
 		 101 aa  42  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>