More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3938 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 350 aa  685    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 		 346 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  55.36 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.06 
 
 		 346 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  56.23 
 
 		 346 aa  334  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1263  histidine kinase  55.59 
 
 		 346 aa  323  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1532  histidine kinase  53.03 
 
 		 353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.628543  normal  0.374808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.71 
 
 		 423 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  47.67 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 478 aa  266  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  45.66 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 422 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  44.54 
 
 		 451 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  47.38 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  44.8 
 
 		 450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.67 
 
 		 449 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  44.93 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0381  histidine kinase  45.37 
 
 		 430 aa  249  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0298  sensor histidine kinase, putative  45.86 
 
 		 438 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0312  putative sensor histidine kinase  45.86 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 417 aa  245  9e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1535  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 		 459 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.896315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2916  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 430 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.301233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2689  histidine kinase  46.67 
 
 		 430 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0757  two component sensor histidine kinase  44.44 
 
 		 435 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  46.22 
 
 		 510 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0177  histidine kinase  43.24 
 
 		 407 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0167  histidine kinase  44.28 
 
 		 407 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114642  normal  0.326562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0478  histidine kinase  41.24 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  46.69 
 
 		 443 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  41.64 
 
 		 424 aa  225  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0496  phosphate regulon sensor kinase PhoR  41.86 
 
 		 419 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27503  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2689  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 402 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10288  normal  0.570693 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 585 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 482 aa  219  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 592 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3575  histidine kinase  44.22 
 
 		 416 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455968  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 456 aa  212  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4551  histidine kinase  39.77 
 
 		 480 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 489 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 		 581 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  34.86 
 
 		 587 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  34.86 
 
 		 587 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  34.57 
 
 		 587 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 585 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  34.29 
 
 		 587 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  34.29 
 
 		 587 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  34.29 
 
 		 587 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  34.29 
 
 		 587 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  32.95 
 
 		 598 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  34 
 
 		 587 aa  203  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  34 
 
 		 587 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 584 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 584 aa  202  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 587 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  39.26 
 
 		 591 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 585 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  35.07 
 
 		 571 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 444 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 412 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 582 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 		 442 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  34.78 
 
 		 571 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2776  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 432 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000654032  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 454 aa  192  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.434659  normal  0.0783763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1559  phosphate regulon sensor protein PhoR  36.87 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  35.07 
 
 		 584 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 432 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200806  hitchhiker  0.00000878354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2708  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 432 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000004963  decreased coverage  0.000000358257 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  33.53 
 
 		 575 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  35.96 
 
 		 555 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 600 aa  189  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 607 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000304613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1404  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000894019  normal  0.0243022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1379  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000050186  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2980  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000022152  hitchhiker  0.00348527 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  35.4 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  37.13 
 
 		 537 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000005048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 591 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  39.89 
 
 		 439 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 589 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2767  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 431 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00352447  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 446 aa  185  9e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  47.41 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  43.24 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2688  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.18 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000622001  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 554 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 433 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  33.43 
 
 		 554 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>