144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2851 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  100 
 
 		 142 aa  270  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  55.64 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  54.89 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  54.14 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  47.83 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  43.17 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  43.61 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  44.33 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  38.33 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  43.33 
 
 		 161 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  46.39 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  47.12 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  44.34 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  41.59 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  39.45 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  45.57 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3087  HPr kinase  48.41 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  36.89 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  41.8 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  47.95 
 
 		 320 aa  63.9  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  44.23 
 
 		 186 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  37.84 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  42.37 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  41.74 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  38.89 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  36.59 
 
 		 308 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  43.27 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  39.5 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  46.15 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  30.82 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  37.4 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  29.08 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  34.71 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  44.44 
 
 		 311 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  40.38 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0110  HPr kinase  47.22 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  39.05 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  40 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  36.19 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2129  HPr kinase  43.28 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.163054  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1043  HPr kinase  34.69 
 
 		 346 aa  53.9  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  30.12 
 
 		 313 aa  52  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  45.31 
 
 		 309 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  31.71 
 
 		 308 aa  52  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  34.82 
 
 		 311 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  38.94 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  40.91 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  36.99 
 
 		 319 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  45.31 
 
 		 309 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  45.31 
 
 		 309 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4209  HPr kinase  40 
 
 		 339 aa  50.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  0.955997 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  45.31 
 
 		 309 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  45.31 
 
 		 309 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  45.31 
 
 		 309 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  45.31 
 
 		 309 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  45.31 
 
 		 309 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  45.31 
 
 		 309 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  45.31 
 
 		 309 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  45.31 
 
 		 309 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0412  HPr kinase  45.31 
 
 		 315 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0747  HPr kinase  43.55 
 
 		 282 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.659883  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0757  HPr kinase/phosphorylase  30.95 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.825604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0328  HPr kinase  34.82 
 
 		 309 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1208  HPr kinase/phosphorylase  30.95 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  37.11 
 
 		 311 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  32.8 
 
 		 330 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  38.67 
 
 		 305 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0238  HPr kinase  38.71 
 
 		 320 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2758  HPr kinase  42.86 
 
 		 324 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.391221  normal  0.0327459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2552  HPr kinase  30.19 
 
 		 339 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4556  HPr kinase/phosphorylase  43.55 
 
 		 318 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16040  HPr kinase  31.25 
 
 		 308 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  31.48 
 
 		 320 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  34.67 
 
 		 307 aa  47.4  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  34.67 
 
 		 307 aa  47.4  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0951  HPr kinase/phosphorylase  37.5 
 
 		 316 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421002 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4146  HPr kinase/phosphorylase  43.21 
 
 		 311 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.53594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0352  HPr kinase/phosphorylase  34.04 
 
 		 323 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0287  HPr kinase/phosphorylase  34.04 
 
 		 324 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  34.04 
 
 		 323 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  33.06 
 
 		 321 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  31.2 
 
 		 322 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0602  HPr kinase/phosphorylase  40.32 
 
 		 318 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0473  HPr kinase/phosphorylase  43.55 
 
 		 325 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0260  HPr kinase/phosphorylase  34.04 
 
 		 324 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0405  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 		 324 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  31.15 
 
 		 312 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  31.2 
 
 		 333 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3273  HPr kinase/phosphorylase  41.94 
 
 		 318 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617288  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3792  HPr kinase/phosphorylase  41.94 
 
 		 316 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3925  HPr kinase/phosphorylase  41.94 
 
 		 318 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4645  HPr kinase  31.37 
 
 		 276 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1002  HPr kinase/phosphorylase  41.94 
 
 		 318 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2739  HPr kinase  37.97 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.192127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0690  HPr kinase/phosphorylase  36.99 
 
 		 331 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3022  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  41.27 
 
 		 310 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  43.55 
 
 		 310 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0976  HPr kinase/phosphorylase  36.49 
 
 		 319 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2630  HPr kinase  41.27 
 
 		 310 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0668  HPr kinase/phosphorylase  37.18 
 
 		 316 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>