168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2680 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2680  glucokinase  100 
 
 		 307 aa  603  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1145  glucokinase  37.3 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1943  glucokinase  34.64 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2875  glucokinase  37.3 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1521  glucokinase  37.3 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540329  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1655  glucokinase  34.31 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692782  hitchhiker  0.0000702574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  34.04 
 
 		 338 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  29.11 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  33.88 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  29.6 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  29.6 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  31.35 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  31.13 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  30.28 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  30.56 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  32.45 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  31.87 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  34.32 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  29.63 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  29.03 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  29.6 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  31.56 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  29 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  34.21 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  29.84 
 
 		 346 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  29.5 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  30.19 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  31 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  29.43 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  29.32 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  30.82 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  27.07 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2047  glucokinase  32.02 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.865075  normal  0.732847 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  29.88 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  30.65 
 
 		 322 aa  90.1  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  30.67 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  30.5 
 
 		 333 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  30.5 
 
 		 333 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  28.43 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  30.2 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  28.75 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  29.25 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  29.25 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  29.25 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  29.25 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  23.9 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  29.25 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  29.25 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  27.27 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  29.25 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  29.25 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  26.56 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  28.71 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  28.84 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  28.84 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  28.84 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  28.71 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  29.25 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  28.71 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  26.37 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  28.71 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  28.71 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  26.63 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00609  glucokinase  29.97 
 
 		 328 aa  85.9  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  28.75 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  27.73 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0373  glucokinase  29.51 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  29.61 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  28.3 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10541  putative glucokinase  23.8 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.237851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  28.26 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 616 aa  83.2  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4129  glucokinase  28 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1032  glucokinase  29.93 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  32.93 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  32.93 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  31.52 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1119  glucokinase  33.22 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  27.36 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  29.43 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  24.85 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  29.68 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  27.9 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  24.92 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  28.09 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  28.16 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  25.93 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0309  glucokinase  34.09 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1289  glucokinase  28.34 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1147  glucokinase  35.29 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  28.52 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  25.92 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3372  Glucokinase  32.17 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0415975  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0161  Glucokinase  29.48 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 642 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  24.92 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18591  putative glucokinase  26.65 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0624  glucokinase  26.33 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.211034  normal  0.0379456 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0032  glucokinase  22.94 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1110  glucokinase  28.53 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>