189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2380 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2380  metallophosphoesterase  100 
 
 		 262 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0169412  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  42.97 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  40.46 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  40.46 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  39.67 
 
 		 291 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  30.8 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  41.67 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  30.36 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  38.81 
 
 		 265 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3901  metallophosphoesterase  37.08 
 
 		 267 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  37.66 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  41.45 
 
 		 294 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  35.37 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  34.55 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  40.41 
 
 		 292 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  40.41 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  36.32 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  35.05 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  36.49 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  31.85 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  31.09 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  34.9 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2358  metallophosphoesterase  40.18 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  32.26 
 
 		 289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  31.15 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3489  metallophosphoesterase  37.73 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841286  normal  0.462378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  32.14 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1186  metallophosphoesterase  31.85 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00040715  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  36.65 
 
 		 271 aa  95.5  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  31.82 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  30 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  33.51 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  29 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.73 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.92 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  27.43 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  25.64 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  29.9 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1769  metallophosphoesterase  32.5 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0421028  normal  0.0147322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  26.94 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1810  metallophosphoesterase  28.48 
 
 		 706 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24784  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0504  metallophosphoesterase  27.62 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0551337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4744  metallophosphoesterase  35.34 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.158443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  26.8 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  28.83 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1472  metallophosphoesterase  24.22 
 
 		 466 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.114222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  25.88 
 
 		 318 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0641  metallophosphoesterase  29.75 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0332  metallophosphoesterase  41.67 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1184  purple acid phosphatase family protein  30.77 
 
 		 281 aa  52.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0863816  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1087  purple acid phosphatase family protein  30.77 
 
 		 281 aa  52.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  30.46 
 
 		 319 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  27.69 
 
 		 320 aa  52  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2104  metallophosphoesterase  45.21 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  27.98 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  26.72 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1670  metallophosphoesterase  29.81 
 
 		 281 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6480  metallophosphoesterase  41.67 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.0842376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.57 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1456  metallophosphoesterase  24.55 
 
 		 361 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  26.2 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4366  metallophosphoesterase  24.59 
 
 		 489 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3391  metallophosphoesterase  21.98 
 
 		 363 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119138  normal  0.040425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5048  metallophosphoesterase  30.53 
 
 		 417 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475104  hitchhiker  0.00471023 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  27.32 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  24.66 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  25.36 
 
 		 300 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1476  phosphoesterase  41.33 
 
 		 297 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195821  hitchhiker  0.0000667392 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3572  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000400387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3856  Ser/thr protein phosphatase family protein  40 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000402293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3471  Ser/thr protein phosphatase family protein  40 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000520095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3484  Ser/thr protein phosphatase family protein  40 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0169244  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  24.66 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3738  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18661e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3776  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40 
 
 		 297 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000444173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3825  phosphoesterase  41.33 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0357968  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  29.21 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3064  metallophosphoesterase  25.3 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283144  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  23.39 
 
 		 369 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0534  putative ICC protein  22.12 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3754  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.67 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1067  metallophosphoesterase  27.96 
 
 		 353 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  28.1 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1644  metallophosphoesterase  38.71 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  28.66 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  28.05 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3492  metallophosphoesterase  38.67 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00129162  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  25.12 
 
 		 331 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  34.12 
 
 		 1183 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  22.96 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  26.2 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  25.12 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  26.94 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4538  metallophosphoesterase  30.53 
 
 		 416 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.855736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  23.79 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3228  hypothetical protein  23.86 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00856854  normal  0.0495142 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3442  metallophosphoesterase  24.4 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  0.817537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1581 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7589  hypothetical protein  26.57 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.679516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>