39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7589 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7589  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  569  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.679516  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0641  metallophosphoesterase  35.06 
 
 
271 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1184  purple acid phosphatase family protein  38.1 
 
 
281 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0863816  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1670  metallophosphoesterase  36.63 
 
 
281 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1087  purple acid phosphatase family protein  38.1 
 
 
281 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1769  metallophosphoesterase  32.97 
 
 
276 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0421028  normal  0.0147322 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  23.63 
 
 
343 aa  55.8  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  27.48 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  24.43 
 
 
364 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  25.56 
 
 
369 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3876  metallophosphoesterase  27.37 
 
 
366 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  27.1 
 
 
611 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  29.95 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3826  metallophosphoesterase  26.82 
 
 
366 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  27.23 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.76 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3391  metallophosphoesterase  26.92 
 
 
363 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119138  normal  0.040425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1191  metallophosphoesterase  23.81 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  26.4 
 
 
357 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  25.93 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  26.61 
 
 
239 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3228  hypothetical protein  23.88 
 
 
219 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00856854  normal  0.0495142 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  26.61 
 
 
239 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  25.48 
 
 
313 aa  46.2  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.46 
 
 
277 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  25.73 
 
 
616 aa  45.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1810  metallophosphoesterase  23.14 
 
 
706 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24784  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  24.59 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1456  metallophosphoesterase  23.45 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  40.26 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  30.23 
 
 
312 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2512  hypothetical protein  26.44 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2463  hypothetical protein  26.44 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  28.19 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  27.66 
 
 
270 aa  43.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  22.83 
 
 
311 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  24.51 
 
 
277 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0728  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  23.83 
 
 
279 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.799636  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  28.1 
 
 
278 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>