More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1771 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 445 aa  880    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.6 
 
 		 439 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  55.16 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.38 
 
 		 439 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1921  histidine kinase  53.35 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000693193  hitchhiker  0.00000000000506219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.35 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 442 aa  359  5e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 453 aa  276  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 462 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 460 aa  269  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 462 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  40.13 
 
 		 472 aa  266  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  38.31 
 
 		 458 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3166  two component sensor kinase  39.91 
 
 		 440 aa  262  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 450 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 466 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 477 aa  257  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 462 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 447 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291283  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  37.56 
 
 		 468 aa  255  9e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  37.61 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  37.64 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  37.56 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 472 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 462 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 469 aa  252  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  37.15 
 
 		 416 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 468 aa  221  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.09 
 
 		 441 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 467 aa  177  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.913369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  40.98 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  38.11 
 
 		 425 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  39.02 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 443 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  29.96 
 
 		 450 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  29.96 
 
 		 450 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  29.74 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  30.77 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  36.27 
 
 		 444 aa  144  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 717 aa  143  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  35.35 
 
 		 473 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  35.35 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  30.18 
 
 		 470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 454 aa  140  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  29.85 
 
 		 450 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  27.19 
 
 		 430 aa  140  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 488 aa  140  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 488 aa  140  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 484 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 480 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 484 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  34.77 
 
 		 499 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  34.97 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  34.97 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  34.97 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000106108  normal  0.933142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  34.97 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  34.97 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 473 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  34.97 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  29.44 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  29.44 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  29.44 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  29.44 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  29.44 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  33.33 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  41.92 
 
 		 358 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  34.64 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 484 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 453 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 469 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 444 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 546 aa  136  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  39.41 
 
 		 471 aa  136  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  37 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  28.85 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  35.19 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  32.37 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 494 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  27.61 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  32.37 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>