More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1758 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1758  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  295  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00375085  normal  0.163096 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  82.31 
 
 		 152 aa  240  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1867  AsnC family transcriptional regulator  81.63 
 
 		 152 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0516  AsnC family transcriptional regulator  80.27 
 
 		 152 aa  236  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.904906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1240  AsnC family transcriptional regulator  74.15 
 
 		 151 aa  227  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  73.2 
 
 		 152 aa  224  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2301  AsnC family transcriptional regulator  72.11 
 
 		 152 aa  219  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 159 aa  114  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.89 
 
 		 155 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  38.57 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 156 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  37.14 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 155 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.43 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  36.57 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  41.73 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  41.73 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  36.91 
 
 		 173 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  41.73 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  41.73 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 163 aa  94.4  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 158 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 181 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 181 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 181 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 181 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  40.16 
 
 		 166 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  34.69 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2595  transcriptional regulator, AsnC family  38.4 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 154 aa  90.5  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  90.5  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 152 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  34.01 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0652  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.22955 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 166 aa  89.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  37.8 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>