More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1091 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1291  exodeoxyribonuclease VII large subunit  93.39 
 
 
516 aa  991    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00804407  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1091  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
514 aa  1056    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1369  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.25 
 
 
508 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0465393 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4878  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.22 
 
 
576 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.983312 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1209  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.63 
 
 
522 aa  264  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000650219  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.56 
 
 
413 aa  206  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214735  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0198  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.99 
 
 
555 aa  203  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1128  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37 
 
 
460 aa  176  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7199  Exodeoxyribonuclease VII  28.63 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0236  Exodeoxyribonuclease VII  29.08 
 
 
526 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1869  exodeoxyribonuclease VII  30.2 
 
 
530 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.205151  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2199  Exodeoxyribonuclease VII  32.42 
 
 
464 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.503662  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0178  exodeoxyribonuclease VII  28.48 
 
 
526 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3775  exodeoxyribonuclease VII  28.46 
 
 
478 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0501  Exodeoxyribonuclease VII  30.41 
 
 
404 aa  133  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3317  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.81 
 
 
387 aa  120  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.64 
 
 
475 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1722  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.93 
 
 
459 aa  105  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.209021  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1002  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.58 
 
 
454 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000181465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.73 
 
 
427 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  24.89 
 
 
457 aa  104  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.89 
 
 
447 aa  103  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.11 
 
 
451 aa  103  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4244  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.98 
 
 
444 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.2 
 
 
460 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955357  normal  0.27096 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1188  Exodeoxyribonuclease VII  30.28 
 
 
529 aa  100  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0154172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.34 
 
 
452 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.34 
 
 
452 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.9 
 
 
454 aa  100  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.6 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.11 
 
 
452 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.14 
 
 
442 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.11 
 
 
452 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.49 
 
 
452 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1926  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.26 
 
 
439 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.11 
 
 
452 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.11 
 
 
452 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.11 
 
 
452 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.23 
 
 
454 aa  98.2  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2946  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.8 
 
 
436 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.877345 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.78 
 
 
406 aa  97.8  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.11 
 
 
452 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.47 
 
 
408 aa  97.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  23.88 
 
 
452 aa  97.4  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.98 
 
 
398 aa  97.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.11 
 
 
452 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  28.93 
 
 
450 aa  97.4  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.8 
 
 
451 aa  97.1  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.68 
 
 
407 aa  97.1  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.31 
 
 
424 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3498  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.35 
 
 
526 aa  96.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  22.98 
 
 
460 aa  96.3  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.18 
 
 
388 aa  96.3  1e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.51 
 
 
449 aa  96.3  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.94 
 
 
384 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.59 
 
 
388 aa  95.9  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.66 
 
 
511 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286827 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  27.6 
 
 
405 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.71 
 
 
442 aa  94.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2552  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.92 
 
 
432 aa  94.7  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.58 
 
 
450 aa  94.4  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2644  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.06 
 
 
436 aa  94.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.62 
 
 
448 aa  93.6  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.41 
 
 
442 aa  93.6  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0952  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.91 
 
 
496 aa  93.2  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.98 
 
 
464 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.76 
 
 
446 aa  92.8  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.14 
 
 
458 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1761  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.24 
 
 
455 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.16 
 
 
445 aa  92  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  25.78 
 
 
462 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.18 
 
 
448 aa  92  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.26 
 
 
460 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2568  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.01 
 
 
460 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0973694  normal  0.16842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  23.69 
 
 
501 aa  90.9  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.01 
 
 
460 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2544  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.01 
 
 
460 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.61 
 
 
456 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.61 
 
 
456 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.04 
 
 
460 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  26.61 
 
 
456 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.97 
 
 
393 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.74 
 
 
455 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.95 
 
 
445 aa  90.1  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0612657  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2149  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.53 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2272  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.53 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00826344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1044  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.53 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000021456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0929  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.53 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.344174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.61 
 
 
456 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.33 
 
 
457 aa  89.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0932  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.53 
 
 
460 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29303  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.57 
 
 
458 aa  89.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0494  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.37 
 
 
519 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2204  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.18 
 
 
486 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0743  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.32 
 
 
561 aa  89  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  26.4 
 
 
456 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0567  exodeoxyribonuclease VII large subunit  23.53 
 
 
510 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0175948  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1008  exonuclease VII large subunit  25.52 
 
 
467 aa  89  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.79 
 
 
456 aa  89  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.02 
 
 
448 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>