48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0704 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0704  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  527  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3697  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  37.11 
 
 		 266 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0245  hypothetical protein  36.65 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02060  hypothetical protein  36.65 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520939  normal  0.571612 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4054  hypothetical protein  35.43 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1700  hypothetical protein  35.98 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  36.48 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  37.08 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  37.08 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2592  nucleoside-binding outer membrane protein  32.96 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  33.72 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1698  hypothetical protein  32.58 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  35.42 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  36.63 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3618  hypothetical protein  33.08 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  32.95 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  32.95 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0461  hypothetical protein  32.42 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1804  hypothetical protein  35.29 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0626239  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3214  hypothetical protein  31.09 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3671  hypothetical protein  35.29 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3389  hypothetical protein  32.69 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00215189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0492  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  33.86 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000160917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3402  hypothetical protein  33.2 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0468  hypothetical protein  33.86 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000281501  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0489  hypothetical protein  33.86 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000981799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3851  hypothetical protein  33.86 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0452291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0413  hypothetical protein  33.05 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4508  hypothetical protein  32.17 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0544  hypothetical protein  33.47 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000326106  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3504  hypothetical protein  33.47 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3679  hypothetical protein  33.47 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0284056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4131  hypothetical protein  33.07 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0462  hypothetical protein  31.78 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0448  hypothetical protein  33.07 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00784696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2763  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  30.5 
 
 		 286 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251865  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  29.75 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  29.75 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1461  hypothetical protein  26.03 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0083992  normal  0.0205194 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0194  hypothetical protein  30.04 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7975  normal  0.0633994 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4879  hypothetical protein  25.65 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000399602  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01608  hypothetical protein  23.74 
 
 		 259 aa  52  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0854  hypothetical protein  23.02 
 
 		 314 aa  43.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0870  hypothetical protein  22.3 
 
 		 304 aa  43.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  28.05 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0187  hypothetical protein  28.31 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0640  hypothetical protein  22.05 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0177  hypothetical protein  27.85 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.713561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>