More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1166 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 248 aa  481  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  60 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  64.55 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  60.66 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  63.56 
 
 		 250 aa  294  9e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  59.31 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  58.87 
 
 		 247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  60.54 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  61.23 
 
 		 257 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  58.56 
 
 		 261 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  55.08 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  52.92 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  61.65 
 
 		 222 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  61.73 
 
 		 222 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  60.73 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  54.05 
 
 		 248 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  55.86 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  53.33 
 
 		 249 aa  251  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  51.13 
 
 		 252 aa  251  7e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  56.31 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  52.1 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  52.1 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  54.24 
 
 		 250 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  56.76 
 
 		 255 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  52.1 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  55.32 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  52.1 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  53.28 
 
 		 281 aa  248  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  55.86 
 
 		 251 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  54.42 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  54.95 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  55.8 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  54.95 
 
 		 223 aa  247  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  56.7 
 
 		 299 aa  247  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  52.34 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  55.86 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  50.99 
 
 		 260 aa  245  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  52.34 
 
 		 248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  53.6 
 
 		 248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  53.6 
 
 		 248 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  53.6 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  51.25 
 
 		 251 aa  244  8e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  52.1 
 
 		 253 aa  244  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  51.35 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  55.41 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  61.9 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  51.75 
 
 		 244 aa  243  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  51.35 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  55.86 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  53.15 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  52.61 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  54.78 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  55.36 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  51.35 
 
 		 244 aa  242  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  48.61 
 
 		 266 aa  241  7e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  51.27 
 
 		 251 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  54.63 
 
 		 251 aa  241  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  55.41 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4138  flagellar biosynthesis protein FliP  58.72 
 
 		 259 aa  239  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00317054  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  53.91 
 
 		 317 aa  239  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  55.36 
 
 		 289 aa  239  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  55.4 
 
 		 280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  52.02 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  52.51 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  55.35 
 
 		 262 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  52.23 
 
 		 253 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  52.73 
 
 		 254 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  51.95 
 
 		 249 aa  238  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  51.29 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  52.27 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  50.22 
 
 		 245 aa  238  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  51.67 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  51.36 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  52.7 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  55.45 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  54.58 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  57.89 
 
 		 262 aa  235  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  54.58 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  55.66 
 
 		 250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  53.05 
 
 		 254 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  52.16 
 
 		 277 aa  235  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  49.58 
 
 		 238 aa  235  6e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  53.12 
 
 		 265 aa  234  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  56.02 
 
 		 254 aa  234  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  53.42 
 
 		 234 aa  234  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  56.13 
 
 		 258 aa  234  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  55.95 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  52.38 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  53.12 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  47.75 
 
 		 244 aa  233  3e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  51.9 
 
 		 249 aa  232  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  53.12 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  58.64 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3565  flagellar biosynthesis protein FliP  53.75 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.809512  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0377  flagellar biosynthesis protein FliP  56.56 
 
 		 225 aa  232  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  51.36 
 
 		 283 aa  231  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  50.44 
 
 		 248 aa  231  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  51.38 
 
 		 287 aa  231  9e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  52.36 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  52.84 
 
 		 260 aa  230  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>