192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1111 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  100 
 
 		 143 aa  294  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  47.1 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  48.39 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  46.46 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  44.19 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  44.07 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  40.6 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  43.85 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  40.15 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  42.61 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  41.67 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  37.04 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  39.66 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  37.7 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  39.85 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  35.66 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  40.18 
 
 		 126 aa  92  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  34.11 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  42.31 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  36.29 
 
 		 138 aa  86.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  35.25 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  38.84 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  36.89 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  38.02 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  34.11 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  35.09 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  39.62 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  39.62 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  39.62 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  39.62 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  39.62 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  37.5 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  38.46 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  37.39 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  37.39 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  40.38 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  39.62 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  34.45 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  36.19 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  35.54 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  35.59 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  34.21 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  38.68 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  33.61 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  36.79 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  34.68 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  35.4 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0203  flagellar protein FliS  35.4 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  36.44 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  32.84 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  36.44 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  36.44 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  35.65 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  35.09 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  31.9 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2140  flagellar protein FliS  36.44 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0224  flagellar protein FliS  36.44 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  36.44 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3398  flagellar protein FliS  36.44 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  31.93 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  35.24 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  35.24 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  35.24 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  33.96 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0983  flagellar protein FliS  34.78 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0634  flagellar protein FliS  35.04 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  33.61 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  33.88 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  37.19 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  33.88 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  35.43 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  33.96 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  33.96 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1148  flagellar protein FliS  33.64 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  36.79 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  33.04 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  35.24 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  32.17 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1381  flagellar protein FliS  33.63 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  36.79 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  31.03 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  31.03 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  32.48 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  34.91 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  33.94 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  33.94 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  35.85 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  35.85 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  32.17 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0091  flagellar protein FliS  35.29 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  34.29 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  32.14 
 
 		 301 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  31.09 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>