33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0565 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0565  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1118    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000285006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  24.24 
 
 		 600 aa  73.6  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  25.16 
 
 		 833 aa  67.8  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  24.89 
 
 		 823 aa  66.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  28.49 
 
 		 778 aa  64.7  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  29.08 
 
 		 824 aa  60.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  26.94 
 
 		 957 aa  60.1  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4567  hypothetical protein  31.82 
 
 		 900 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4197  hypothetical protein  31.82 
 
 		 900 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382569  normal  0.29939 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  26.24 
 
 		 973 aa  56.6  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  32 
 
 		 1093 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  32.7 
 
 		 926 aa  54.3  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  23.56 
 
 		 573 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  25.49 
 
 		 949 aa  52  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  26.23 
 
 		 953 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  28.11 
 
 		 938 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  33.63 
 
 		 587 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  21.74 
 
 		 573 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  22.22 
 
 		 573 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  22.51 
 
 		 573 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  21.65 
 
 		 573 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  22.08 
 
 		 573 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  25.09 
 
 		 939 aa  49.3  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  20.89 
 
 		 573 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  21.65 
 
 		 573 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  34.12 
 
 		 891 aa  48.5  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  31.33 
 
 		 902 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  22.22 
 
 		 573 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  21.65 
 
 		 573 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1201 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  25.79 
 
 		 939 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  27.95 
 
 		 915 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  25.64 
 
 		 915 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>