39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2131 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  100 
 
 		 257 aa  507  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  72.37 
 
 		 256 aa  396  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  73.33 
 
 		 256 aa  380  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  69.65 
 
 		 256 aa  377  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  39.2 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.63 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.63 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.23 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.83 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.6 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  30.12 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  22.75 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  22.36 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.73 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.18 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.52 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  23.55 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  21.94 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  22.36 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0051  DNA polymerase sliding clamp subunit B  23.83 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.574423  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  22.37 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  20.65 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  21.71 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  22.98 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  20.99 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  24.1 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  22.41 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  23.11 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  23.39 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  22.92 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  17.86 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  20.48 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1375  proliferating cell nuclear antigen-like protein protein  21.43 
 
 		 249 aa  48.9  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.148042  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  23.89 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  21.76 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  18.93 
 
 		 247 aa  45.4  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  18.72 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  22.76 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  20.16 
 
 		 245 aa  42  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>