More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0110 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0110  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
195 aa  369  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.186935 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1180  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  77.89 
 
 
198 aa  291  5e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0140  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  73.2 
 
 
197 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0132  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  75.79 
 
 
198 aa  245  3e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.633264  normal  0.0179048 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1642  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.89 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  89.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4013  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.85 
 
 
210 aa  89.4  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.648921  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1367  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.65 
 
 
197 aa  87.8  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  32.22 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  31.94 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.71 
 
 
226 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3029  hypothetical protein  32.99 
 
 
194 aa  85.5  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.415744  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.71 
 
 
226 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  33.17 
 
 
212 aa  84.3  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.96 
 
 
219 aa  84  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  31.25 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  30.54 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.69 
 
 
213 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  30.84 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  30.05 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.18 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.18 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.64 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1129  MarC family integral membrane protein  28.57 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  31.68 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.22 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3316  multiple antibiotic resistance protein  30.15 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0229288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.64 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  31.37 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.31 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  33.66 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.98 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  31.16 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  31.16 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1254  MarC family integral membrane protein  28.06 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0846  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.43 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.63 
 
 
206 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1228  membrane transporter, MarC family  33.33 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1251  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.88 
 
 
203 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000866197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5328  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.2 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  32.18 
 
 
212 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.14 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.14 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  29.23 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  29.23 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  29.23 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  31.34 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  29.23 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  29.23 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  30.65 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  32.85 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.5 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1671  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.62 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.92 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.37 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.91 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  30.73 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.66 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1083  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.93 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.175416  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.05 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.87 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.05 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.73 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.87 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.36 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3095  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.16 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.103088  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.63 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0042  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.16 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  28.14 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.61 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.02 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4828  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.15 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2139  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.22 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  32.98 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.98 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2518  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.65 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.85 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.87 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.74 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  26.34 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0040  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.62 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0101018 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.17 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  26.63 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  29.65 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4869  membrane protein, MarC family  30.25 
 
 
198 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  26.63 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  26.63 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  26.63 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  26.63 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  26.63 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3746  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.24 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000432224 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  26.63 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  26.63 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>