More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0140 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0140  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 197 aa  374  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1180  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  77.16 
 
 		 198 aa  299  2e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0132  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  75.13 
 
 		 198 aa  258  4e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.633264  normal  0.0179048 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0110  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  73.2 
 
 		 195 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.186935 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1642  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.85 
 
 		 203 aa  93.6  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.68 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1367  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.81 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  32.6 
 
 		 203 aa  85.1  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1129  MarC family integral membrane protein  31.38 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.36 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  34.15 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1254  MarC family integral membrane protein  30.85 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  34.67 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  34.67 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0042  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.57 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.03 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  33.84 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  31.18 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.03 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  34.17 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  33.83 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.82 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3316  multiple antibiotic resistance protein  30.81 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  32.67 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  35.15 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  29.85 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  32.68 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  32.68 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  32.68 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.68 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  32.68 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  33.82 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  32.68 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  32.68 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  32.68 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  34.3 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  34.3 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  32.68 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  34.3 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  31.91 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  31.53 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  35.18 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.94 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  30.89 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  31.53 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  31.53 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  31.53 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  31.53 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  33.82 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4869  membrane protein, MarC family  34.16 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  28.57 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.18 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.46 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.59 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.47 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  30.2 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.47 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1083  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.93 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.175416  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  30.57 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  30.57 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  30.57 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  30.57 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  30.57 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  30.57 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  30.57 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  30.57 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.95 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  33.66 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  30.2 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1228  membrane transporter, MarC family  30.94 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.28 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.55 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4409  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.54 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.05 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1251  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.49 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000866197  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4013  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.47 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.648921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  32.85 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  32.85 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  32.85 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  32.85 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1407  hypothetical protein  29.85 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0713518  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.65 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.47 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0610  multiple antibiotic resistance (MarC)-like proteins  32.34 
 
 		 198 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3029  hypothetical protein  33.93 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.415744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2518  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.93 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.43 
 
 		 198 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.561247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.95 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.02 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  32.28 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.81 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.55991 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  31.01 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.8 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.666037 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.79 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1602  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.13 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0931799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.5 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.79 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.93 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0846  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.51 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>