More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3941 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3941  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 		 196 aa  378  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00858561  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  76.17 
 
 		 200 aa  298  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4828  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  71.65 
 
 		 200 aa  288  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  71.65 
 
 		 201 aa  287  8e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000587545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4152  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  69.59 
 
 		 198 aa  285  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0092  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  71.35 
 
 		 197 aa  286  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0045  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  70.83 
 
 		 218 aa  285  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3626  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  70.62 
 
 		 198 aa  285  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0129  hypothetical protein  69.79 
 
 		 197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4231  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  70.83 
 
 		 197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  70.83 
 
 		 197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0127  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  70.83 
 
 		 197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  70.31 
 
 		 197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0309852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  70.31 
 
 		 197 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0487313  hitchhiker  0.00000474402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  70.31 
 
 		 197 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3746  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  69.27 
 
 		 197 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000432224 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  69.79 
 
 		 199 aa  280  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00811054  hitchhiker  0.000115655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0118  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  69.27 
 
 		 197 aa  279  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  62.5 
 
 		 194 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  60.94 
 
 		 197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  60.42 
 
 		 197 aa  231  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  64.52 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  64.52 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  64.52 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  64.52 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  64.52 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  64.52 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  64.52 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  64.52 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  63.98 
 
 		 197 aa  228  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002135  multiple antibiotic resistance protein marC  63.02 
 
 		 194 aa  228  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  63.44 
 
 		 197 aa  226  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0218  putative dITP- and XTP- hydrolase  60.94 
 
 		 197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0268  putative dITP- and XTP- hydrolase  60.42 
 
 		 197 aa  218  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4111  putative dITP- and XTP- hydrolase  60.94 
 
 		 197 aa  217  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.779903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0140  putative dITP- and XTP- hydrolase  60.94 
 
 		 197 aa  217  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4015  putative dITP- and XTP- hydrolase  60.94 
 
 		 194 aa  217  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4649  putative dITP- and XTP- hydrolase  61.98 
 
 		 197 aa  214  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.59 
 
 		 196 aa  202  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2224  hypothetical protein  54.4 
 
 		 198 aa  194  6e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01317  multiple antibiotic resistance protein MarC  52.82 
 
 		 199 aa  193  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.355681  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2133  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.89 
 
 		 198 aa  192  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.382679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2864  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.08 
 
 		 212 aa  191  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.4 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.4 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  49.47 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0514  multiple antibiotic resistance (MarC)- related protein, putative transporter  48.15 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3442  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.09 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00112955  hitchhiker  0.00103877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0614  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.68 
 
 		 200 aa  164  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2645  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.03 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2597  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.85 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370688  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.11 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0188  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.97 
 
 		 197 aa  158  4e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1147  hypothetical protein  45.26 
 
 		 200 aa  157  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.938365  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2516  MarC membrane protein  45.79 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.376397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3517  hypothetical protein  45.79 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.836337  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3481  MarC membrane protein  45.79 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3266  MarC membrane protein  45.79 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3519  MarC membrane protein  45.79 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1297  MarC membrane protein  45.79 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0438  MarC membrane protein  45.79 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0558  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.26 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  hitchhiker  0.000600217 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0588  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  45.26 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3673  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.74 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2198  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.5 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.617868  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0491  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.21 
 
 		 200 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0516  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.74 
 
 		 200 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0622801  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.74 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.04 
 
 		 205 aa  153  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0106  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.74 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.22 
 
 		 222 aa  153  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.302535  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  42.56 
 
 		 197 aa  151  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  42.56 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6285  hypothetical protein  47.62 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0447  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.79 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72410  hypothetical protein  47.62 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  36.84 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0182  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.47 
 
 		 199 aa  148  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000388483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2070  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.11 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1018  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.86 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1167  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.67 
 
 		 200 aa  124  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.22 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  34.55 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.55 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.6 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.38 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.38 
 
 		 203 aa  104  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  29.95 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.9 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  31.96 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00158  multiple antibiotic transporter  29.95 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2908  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein protein  33.51 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.275757  normal  0.0232741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.32 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.87 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174302  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.64 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  26.73 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1724  MarC family integral membrane protein  34.04 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0241  hypothetical protein  29.47 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.425309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.22 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>