More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2098 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 285 aa  578  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  35.13 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  36.92 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1554  cation diffusion facilitator family transporter  34.86 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  31.82 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  31.18 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  32.73 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0941  cation efflux protein  33.8 
 
 		 308 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  27.96 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  32.95 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3105  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3015  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  32.09 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  32.75 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  32.87 
 
 		 389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  29.82 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.14 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  31.75 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  29.82 
 
 		 380 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  30.07 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  31.6 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  29.35 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  31.02 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  30.07 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  29.43 
 
 		 318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.71 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  29.71 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  29.71 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.71 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  29.71 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  31.23 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 		 396 aa  119  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  32.96 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  32.96 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  30.11 
 
 		 388 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1201  cation efflux protein  35.14 
 
 		 460 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  31.97 
 
 		 460 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  31.73 
 
 		 311 aa  116  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  31.44 
 
 		 459 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  29.35 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  33.19 
 
 		 462 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  30.04 
 
 		 354 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  28.36 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  29.06 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  29.23 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  29.06 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  29.06 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  30.85 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 		 460 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  28.68 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  27.15 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  34.65 
 
 		 460 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  28.68 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  28.68 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  28.68 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  28.68 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  28.68 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  28.32 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  30.31 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0344  cation transporter  30.89 
 
 		 427 aa  112  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  27.15 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  29.21 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  27.92 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  27.15 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 		 404 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 		 404 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  31.02 
 
 		 389 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  28.46 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  27.7 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1042  Co/Zn/Cd cation transporter  28.99 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0463512  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 		 460 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  28.57 
 
 		 314 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  35.85 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  30.32 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  28.37 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  31.34 
 
 		 481 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  25.55 
 
 		 381 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  28.72 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  29.74 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  29.89 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  26.98 
 
 		 385 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  30.58 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  28.06 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  26.98 
 
 		 385 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  29.1 
 
 		 466 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45119  predicted protein  28.71 
 
 		 591 aa  106  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>