More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1882 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1882  cysteine synthases  100 
 
 		 343 aa  704    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  51.63 
 
 		 304 aa  315  9e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  51.61 
 
 		 311 aa  312  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  50.65 
 
 		 304 aa  311  1e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  53.25 
 
 		 316 aa  309  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  54.55 
 
 		 308 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  53.57 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  51.57 
 
 		 319 aa  305  9.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  51.29 
 
 		 339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  52.35 
 
 		 329 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  50.65 
 
 		 311 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  50.32 
 
 		 328 aa  298  8e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  51.14 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  51.78 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  49.35 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  54.66 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  47.57 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  49.02 
 
 		 307 aa  293  3e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  52.44 
 
 		 309 aa  293  4e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  49.19 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  48.38 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  49.84 
 
 		 317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  52.1 
 
 		 308 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  52.94 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  50 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0556  cysteine synthases  53.25 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  49.51 
 
 		 327 aa  286  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  52.29 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  46.25 
 
 		 299 aa  285  5.999999999999999e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  50.16 
 
 		 310 aa  285  5.999999999999999e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  51.15 
 
 		 308 aa  285  7e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  50.16 
 
 		 310 aa  285  8e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  46.25 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  54.52 
 
 		 309 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  48.34 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  50.65 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  52.43 
 
 		 331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  48.21 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  49.84 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  50 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  49.84 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  48.87 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  54.84 
 
 		 309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  50.81 
 
 		 317 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  52.27 
 
 		 309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  47.65 
 
 		 324 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  50.81 
 
 		 317 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  51.31 
 
 		 309 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  49.19 
 
 		 325 aa  281  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  48.69 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  50 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  47.06 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  50.65 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  53.9 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  50.33 
 
 		 309 aa  280  4e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  51.62 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 328 aa  278  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  50.98 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  50.16 
 
 		 308 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  50.98 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  52.58 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  50.32 
 
 		 311 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  47.56 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  52.61 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  50.65 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  45.6 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  51.14 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  51.44 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  50.16 
 
 		 320 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  46.69 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  49.84 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  48.87 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  50.32 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1015  cysteine synthase A  50.77 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  48.53 
 
 		 309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3080  cysteine synthase  49.35 
 
 		 309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  49.35 
 
 		 309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  48.53 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  50 
 
 		 311 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  51.96 
 
 		 314 aa  272  6e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  50.49 
 
 		 309 aa  271  9e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  50.79 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  47.9 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  49.35 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  49.68 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  49.35 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  50.81 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0241  cysteine synthase  48.22 
 
 		 315 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  51.63 
 
 		 306 aa  269  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  50.16 
 
 		 332 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1773  cysteine synthases  48.38 
 
 		 325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  48.54 
 
 		 313 aa  269  5.9999999999999995e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  49.84 
 
 		 319 aa  268  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  50.32 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  50.97 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4360  cysteine synthase  49.35 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  50.16 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  48.05 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1893  cysteine synthase A  50.49 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>