More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1773 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1773  cysteine synthases  100 
 
 		 325 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1794  cysteine synthase  91.08 
 
 		 325 aa  544  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.00000000492441  normal  0.123745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4360  cysteine synthase  82.97 
 
 		 322 aa  494  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2594  cysteine synthase A  79.14 
 
 		 326 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  77.53 
 
 		 332 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  77.22 
 
 		 332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  77.53 
 
 		 332 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  71.61 
 
 		 328 aa  424  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  69.3 
 
 		 329 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  68.03 
 
 		 327 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  67.08 
 
 		 327 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  65.93 
 
 		 322 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  69.65 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  64.78 
 
 		 324 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  62.88 
 
 		 328 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  64.04 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  63.61 
 
 		 319 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  61.85 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  61.85 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  61.92 
 
 		 325 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  63.41 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  63.23 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  59.93 
 
 		 311 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  63.09 
 
 		 320 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  62.46 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1015  cysteine synthase A  62.26 
 
 		 328 aa  361  8e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  60.07 
 
 		 311 aa  358  9e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1893  cysteine synthase A  59.82 
 
 		 327 aa  357  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  58.96 
 
 		 311 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  58.9 
 
 		 327 aa  350  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  61.44 
 
 		 310 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0241  cysteine synthase  60.39 
 
 		 315 aa  345  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  59.03 
 
 		 319 aa  343  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  63.52 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  59.28 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  59.55 
 
 		 309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  58.69 
 
 		 308 aa  342  5e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  58.31 
 
 		 317 aa  340  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  61.04 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  56.77 
 
 		 330 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2177  cysteine synthase A  58.1 
 
 		 328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  57.52 
 
 		 308 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  57.65 
 
 		 309 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  58.77 
 
 		 310 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  61.92 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  55.66 
 
 		 309 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  57.33 
 
 		 317 aa  335  5e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  56.31 
 
 		 309 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  57.47 
 
 		 313 aa  335  5e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  55.99 
 
 		 309 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  59.8 
 
 		 311 aa  334  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  56.54 
 
 		 311 aa  333  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  57.98 
 
 		 311 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  56.17 
 
 		 309 aa  332  8e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  57.98 
 
 		 311 aa  331  8e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  57.52 
 
 		 311 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  60.91 
 
 		 309 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  57.28 
 
 		 328 aa  331  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  58.31 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  59.02 
 
 		 308 aa  330  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  56.47 
 
 		 327 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  57.79 
 
 		 320 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  60.26 
 
 		 309 aa  328  9e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  56.77 
 
 		 320 aa  328  9e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  56.39 
 
 		 309 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  57.84 
 
 		 308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  58.31 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  57.28 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  54.9 
 
 		 311 aa  326  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  57.98 
 
 		 309 aa  326  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  58.71 
 
 		 320 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  56.77 
 
 		 320 aa  326  4.0000000000000003e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  58.69 
 
 		 322 aa  325  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  58.63 
 
 		 311 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  58.39 
 
 		 308 aa  325  7e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  56.96 
 
 		 311 aa  325  9e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  55.05 
 
 		 317 aa  325  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  56.03 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  60.13 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  55.16 
 
 		 320 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  55.19 
 
 		 311 aa  322  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  57.61 
 
 		 308 aa  322  5e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  55.37 
 
 		 309 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  55.99 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  56.63 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  58.9 
 
 		 308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  56.54 
 
 		 309 aa  318  7.999999999999999e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  57.65 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  58.28 
 
 		 322 aa  318  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  57.14 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  57.33 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0556  cysteine synthases  56.27 
 
 		 323 aa  317  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523099  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  57.47 
 
 		 321 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  56.54 
 
 		 311 aa  315  7e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  55.23 
 
 		 311 aa  315  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  55.88 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  53.92 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  51.14 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  50.81 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  54.61 
 
 		 316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>