191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2199 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2199  methyltransferase small  100 
 
 
204 aa  412  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0747  methyltransferase small  72.59 
 
 
202 aa  274  6e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0236  methyltransferase  70.3 
 
 
202 aa  272  3e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.140784 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1027  methyltransferase small  72.22 
 
 
202 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.653498  normal  0.0217295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0577  putative RNA methylase  43.35 
 
 
209 aa  167  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0475078  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2885  Methyltransferase type 11  37.75 
 
 
202 aa  135  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  40.41 
 
 
209 aa  125  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0731  methyltransferase  39.46 
 
 
192 aa  115  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0520  methyltransferase small  38.19 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  31.58 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1507  methyltransferase small  30.85 
 
 
207 aa  105  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.113673  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1437  methyltransferase  37.82 
 
 
203 aa  105  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0651  methyltransferase related protein  32.67 
 
 
201 aa  105  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  31.25 
 
 
213 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  35.12 
 
 
204 aa  102  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0891  methyltransferase  30.14 
 
 
213 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0317  DNA methylase  27.35 
 
 
230 aa  99  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  33.68 
 
 
202 aa  94.7  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  36.84 
 
 
203 aa  93.2  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1635  methyltransferase  38.73 
 
 
197 aa  92.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2486  putative RNA methylase  34.07 
 
 
207 aa  87  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1492  methyltransferase small  36.17 
 
 
207 aa  85.9  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  33.51 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3583  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  36.36 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89455  predicted protein  36.82 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0270328  hitchhiker  0.00142671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1798  hypothetical protein  32.84 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  32.31 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf714  N6-adenine-specific methylase  32.05 
 
 
182 aa  52  0.000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
316 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1697  23S rRNA methyluridine methyltransferase  34.02 
 
 
376 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1963  23S rRNA methyluridine methyltransferase  34.02 
 
 
375 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.333439  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  36.36 
 
 
281 aa  49.7  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.92 
 
 
296 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  54.35 
 
 
318 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.07 
 
 
295 aa  48.5  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.65 
 
 
295 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  37.18 
 
 
288 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1650  23S rRNA methyluridine methyltransferase  33.96 
 
 
375 aa  48.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  39.47 
 
 
210 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  32.43 
 
 
285 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.8 
 
 
289 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  28.67 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2390  23S rRNA methyluridine methyltransferase  31.54 
 
 
382 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.437044 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.38 
 
 
304 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0211  putative methyltransferase  30.67 
 
 
183 aa  47  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.785474  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1230  methyltransferase type 11  45.45 
 
 
180 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0668757  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 
293 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000998179  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.8 
 
 
289 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  45.1 
 
 
264 aa  46.2  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0793  hypothetical protein  31.03 
 
 
182 aa  46.6  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.290865  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  37.18 
 
 
262 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1325  hypothetical protein  30.36 
 
 
431 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00779571  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.1 
 
 
299 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.24 
 
 
293 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  37.66 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.24 
 
 
293 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  45.1 
 
 
264 aa  46.2  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.24 
 
 
293 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  39.13 
 
 
182 aa  45.8  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 
280 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
306 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.24 
 
 
293 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.65 
 
 
293 aa  45.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.3 
 
 
294 aa  45.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.94 
 
 
328 aa  45.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.48 
 
 
295 aa  45.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  40 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3635  23S rRNA methyluridine methyltransferase  33.68 
 
 
358 aa  45.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.24 
 
 
293 aa  45.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  41.3 
 
 
311 aa  45.1  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2735  hypothetical protein  34.67 
 
 
179 aa  44.7  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.812643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  32.65 
 
 
285 aa  44.7  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 
293 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.22 
 
 
293 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  31.08 
 
 
359 aa  44.7  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 
296 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  40 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.22 
 
 
293 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.75 
 
 
297 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.3 
 
 
295 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.83 
 
 
327 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  36.84 
 
 
279 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  40.68 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 
295 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  31.08 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 
293 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 
293 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.48 
 
 
293 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  28.97 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  31.94 
 
 
247 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 
293 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.13 
 
 
295 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 
385 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  38.18 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  27.03 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  43.75 
 
 
307 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1568  23S rRNA methyluridine methyltransferase  30.93 
 
 
376 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>